基于连锁不平衡水稻源库相关性状的关联分析
文献类型: 中文期刊
作者: 赵宏亮;陈凯;张强;徐正进;徐建龙;黎志康
作者机构:
关键词: 水稻;SNP标记;连锁不平衡;关联分析
期刊名称:核农学报
ISSN: 1000-8551
年卷期: 2015 年 29 卷 04 期
页码: 674-684
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 为挖掘水稻源库相关性状优异等位基因,利用分布于12条染色体的6 704个SNP标记与来自31个国家和地区的261份籼稻核心种质资源的剑叶长、剑叶宽、剑叶叶面积、倒2叶长、倒2叶宽、倒2叶叶面积、每穗粒数、千粒重、单株产量共9个源库相关性状进行群体结构、连锁不平衡状况和全基因组关联分析。结果表明,261份籼稻核心种质资源的9个源库相关性状的变异系数介于12.46%~26.21%,表型变异丰富。群体结构显示261份籼稻核心种质资源的最适亚群数为3。LD分析表明,SNP位点之间存在着一定程度的连锁不平衡,在显著水平-log P>3(P<10-3)下,共检测到68个与9个水稻源库相关性状显著相关的QTL位点,其中与源性状相关的QTL位点55个,与库性状相关的QTL位点13个。在第2、第5和第11染色体上检测到同时影响源库性状的关联位点4个,可能对通过分子标记辅助育种改良品种的源库性状具有重要参考价值。
分类号: S511
- 相关文献
[1]用全基因组关联分析解析籼稻垩白的遗传基础. 邱先进,袁志华,陈凯,杜斌,何文静,杨隆维,徐建龙,邢丹英,吕文恺. 2015
[2]关联分析及其在果树育种研究中的应用. 赵惠,房玉林,张颖,樊秀彩,孙海生,姜建福,刘崇怀. 2018
[3]豌豆种质表型性状SSR标记关联分析. 顾竟,李玲,宗绪晓,王海飞,关建平,杨涛. 2011
[4]植物关联分析的研究进展及其在茶树分子标记辅助育种上的应用前景. 乔婷婷,姚明哲,周炎花,马春雷,王新超,陈亮,杨亚军. 2009
[5]EST-SSR标记与茶树表型性状关联的初步分析. 姚明哲,乔婷婷,马春雷,金基强,陈亮. 2010
[6]Amy6-4基因遗传多样性及其与α-淀粉酶活性的关联分析. 姜晓东,郭刚刚,张京. 2014
[7]关联分析在玉米遗传学研究中的应用. 赵曦,王荣焕,于永涛,王天宇,黎裕. 2008
[8]陆地棉种质资源群体结构与抗旱、耐盐性状的关联分析. 孙君灵,潘兆娥,何守朴,王立如,庞保印,杜雄明. 2013
[9]关联分析在作物种质资源分子评价中的应用. 王荣焕,王天宇,黎裕. 2007
[10]小麦雌性育性与SSR分子标记的关联分析. 窦秉德,朱晓滨,张新玲,徐海明,侯北伟,徐海风,杨晋彬,高爱农. 2009
[11]关联分析及其在植物遗传学研究中的应用. 吴子恺,程伟东,王天宇,黎裕. 2011
[12]利用高密度SNP遗传图定位水稻蒸煮食味品质相关QTL. 李媛媛,江静,张斌,彭友林,董国军,钱前,高振宇,郭龙彪. 2013
[13]利用SNP标记进行水稻品种籼粳鉴定. 郑向华,叶俊华,程朝平,魏兴华,叶新福,杨窑龙. 2022
[14]关联分析定位水稻第4号染色体的芒性基因并结合连锁分析精细定位Awn4.1. 胡广隆,张冬玲,潘慧乔,李本,吴建涛. 2010
[15]水稻苗期耐亚铁毒和锌毒胁迫的关联分析. 张建,王小倩,向小娇,申聪聪,徐建龙. 2015
[16]水稻中胚轴伸长相关候选基因的关联分析. 刘金栋,王雅美,刘宏岩,孟云,YE Guo-you. 2023
[17]Association Mapping and Functional Analysis of Rice Cold Tolerance QTLs at the Bud Burst Stage. Dan Wang, Zhuo Liu, Yinghui Xiao, Xionglun Liu, Yue Chen, Zhuo Zhang, Houxiang Kang, Xuli Wang, Su Jiang, Shasha Peng, Xinqiu Tan, Deyong Zhang, Yong Liu, Guo-Liang Wang, Chenggang Li. 2021
[18]基于全基因组SNP分析辣椒亲本间遗传距离与产量性状杂种优势的关系. 王昆,张宝玺,张正海,曹亚从,于海龙,王立浩. 2020
[19]普通小麦'Holdfast'条锈病成株抗性QTL定位. 杨芳萍,刘金栋,郭莹,贾奥琳,闻伟鄂,巢凯翔,伍玲,岳维云,董亚超,夏先春. 2019
[20]利用全基因组SNP芯片分析油菜遗传距离与杂种优势的关系. 桑世飞,王会,梅德圣,刘佳,付丽,王军,汪文祥,胡琼. 2015
作者其他论文 更多>>
-
葛根多糖对猫肠道菌群的影响
作者:赵世帆;薛华磊;陈凯;李晓;王米
关键词:葛根多糖;肠道菌群;微生态平衡;宠物食品添加剂
-
Post-transcriptional regulation of grain weight and shape by the RBP-A-J-K complex in rice
作者:任丁;刘慧;孙学军;张帆;姜铃;王莹;江宁;闫培文;崔金浩;杨金水;黎志康;陆平利;罗小金
关键词:
-
Genome-wide association study of seedling nitrogen-use efficiency-associated traits in common wheat (Triticum aestivum L.)
作者:史华伟;高丽锋;马有志;周永斌;徐兆师;陈隽;唐文思;陈凯;陈明
关键词:
-
利用双向导入系和重组自交系定位和挖掘水稻苗期耐冷QTL和有利等位基因
作者:曹慧敏;杨贤莉;王立志;李苹苹;翟来圆;姜树坤;郑天清;邱先进;徐建龙
关键词:水稻;苗期耐冷;枯萎度;QTL定位;单倍型
-
作物产量对土壤pH的响应差异及其影响因素
作者:连旭东;张璐;刘思汝;蔡泽江;郑磊;张强;周建利;徐明岗
关键词:酸害阈值;作物产量;土壤pH;整合分析;有机质;有效磷;氮肥施用
-
利用双向导入系和重组自交系定位和挖掘水稻苗期耐冷 QTL 和有利等位基因
作者:曹慧敏 ;;杨贤莉 ;;王立志;;李苹苹;; 翟来圆;; 姜树坤;; 郑天清;;邱先进;;徐建龙
关键词:
-
不同产区赤霞珠葡萄酒酚类物质特征性分析
作者:吕真真;焦中高;杨文博;张强;刘杰超;刘慧;陈大磊
关键词:赤霞珠;葡萄酒;产区;酚类物质;产区差异性