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牦牛RPL8基因克隆、生物信息学及组织表达分析

文献类型： 中文期刊

作者： 何文斌;平措占堆;张强;尼玛加措;王洪壮;余道宁;张梦帆;王佟;冯芬;喇永富;马晓明;洛桑顿珠;梁春年

作者机构：

关键词： 桑桑牦牛;RPL8基因;基因克隆;生物信息学分析;组织表达

期刊名称：华北农学报

ISSN： 1000-7091

年卷期： 2025 年 40 卷 06 期

页码：

收录情况： 北大核心（2023版） ; ; CSCD（2025-2026年度） ; ; 科技核心（2024版） ; ; 农林核心（2024版）

摘要： 探究桑桑牦牛核糖体蛋白L8基因(RPL8)的结构与理化指标，并通过qPCR技术测定牦牛各组织中RPL8基因的表达水平，旨在为深入探讨RPL8基因在牦牛体内的生物学功能奠定坚实的理论基础。以桑桑牦牛肾脏组织cDNA为模板克隆桑桑牦牛RPL8基因编码区序列(CDS),对CDS区序列进行生信分析，并使用RT-qPCR检测RPL8基因在桑桑牦牛各组织中的相对表达水平。桑桑牦牛RPL8基因的CDS区全长456 bp,共编码151个氨基酸；同源性比对发现桑桑牦牛与家牛的同源性最高，与美洲熊亲缘关系最远；蛋白分析显示，RPL8蛋白内共有潜在磷酸化位点18个，分子质量16.293 89 ku,原子总数2 325,氨基酸等电点为10.90,不稳定系数为41.81,总平均疏水性为-0.687,预测为不稳定亲水性蛋白质，无跨膜结构域和信号肽区域。亚细胞定位显示，RPL8蛋白主要位于细胞核中(65.20%)。RPL8蛋白高级结构由无规则卷曲(49.01%)、延伸链(27.15%)、β-转角(13.91%)和α-螺旋(9.93%)相互连接而成。RT-qPCR结果显示，桑桑牦牛8个组织中均有RPL8基因的表达，在牦牛心脏、肝脏、十二指肠脏组织中表达最高，与其他组织表达差异显著。

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