数字农科院2.0

小麦bHLH家族转录因子的鉴定及其在盐胁迫条件下的表达分析

文献类型： 中文期刊

作者： 吕宝莲;杨宇昕;崔立操;史峰;马亮;孔秀英;张立超;倪志勇

作者机构：

关键词： 小麦;bHLH转录因子;盐胁迫;生物信息学分析

期刊名称：作物杂志

ISSN： 1001-7283

年卷期： 2024 年 1 期

页码：

收录情况： 北大核心（2023版） ; ; 科技核心（2024版） ; ; 农林核心（2020版）

摘要： 碱性螺旋—环—螺旋(basichelix-loop-helix,bHLH)转录因子作为植物中第二大类转录因子家族,在植物生长发育、信号传导、生物合成以及响应非生物胁迫等方面发挥重要功能.为了探讨小麦bHLH转录因子在盐胁迫应答中的功能,以冬性小麦科农199为试验材料,通过转录组测序和生物信息学分析的方法对小麦bHLH转录因子在盐胁迫下的表达特性进行系统分析.结果表明,小麦中共有489个bHLH转录因子,分布在21条染色体上;构建系统进化树将bHLH家族进一步划分为9个亚族,其中Ⅵ亚族成员最多,Ⅳ亚族成员最少;盐胁迫下小麦根转录组测序结果表明,在盐胁迫处理后1和6h差异表达基因(DEG)共有44个,其中上调表达的基因有17个,下调表达的有27个;GO分析表明,DEG富集在水、盐胁迫、生长素调节等方面;KEGG注释分析表明,DEGs主要富集在淀粉和蔗糖代谢途径以及氨基糖和核苷酸糖代谢等信号通路;对部分DEG进行qRT-PCR验证,结果表明DEG的表达模式与转录组测序结果一致,证明了 RNA-Seq结果的准确性.

分类号：

  • 相关文献

[1]小麦盐胁迫相关基因TabHLH13的克隆与分析. 符思路,刘国祥,张立超,夏川,赵光耀,贾继增,孔秀英. 2014

[2]小麦VQ家族全基因组鉴定与表达分析. 李虎滢,魏春茹,孟钰玉,范润侨,于秀梅,刘大群. 2020

[3]小麦ent-柯巴基焦磷酸合酶基因TaCPS1的克隆与荧光定量分析. 郭庆东,李全权,田秋菊,钱艳丽,许田,杨艳林,王洪刚,封德顺. 2016

[4]小麦蔗糖非发酵相关蛋白激酶SnRK3基因的克隆与分析. 杨艳,黄锦雯,夏鹏亮,李义婷,吴兴阳,马东方. 2023

[5]基于物种敏感性分布(SSD)的耐盐与Pb低吸收小麦筛选研究及应用. 孟楠,王萌,雷小琴,陈莉,郑涵,陈世宝. 2019

[6]水杨酸和阿斯匹林对小麦盐害的缓解作用. 张士功,高吉寅,宋景芝. 1999

[7]小麦盐胁迫响应的代谢组学分析. 姜雪敏,陈向前,李红燕,姜奇彦. 2023

[8]小麦根系响应高盐胁迫的时序转录组分析. 李红燕,陈向前,牛凤娟,李彦连,姜奇彦. 2022

[9]森林草莓FvbHLH130转录因子调控植株提前开花. 宋艳红,陈亚铎,张晓玉,宋盼,刘丽锋,李刚,赵霞,周厚成. 2022

[10]日本百脉根LjbHLH34基因克隆及耐旱功能鉴定. 刘福,陈诚,张凯旋,周美亮,张新全. 2022

[11]Wheat; Lumai 14; Germplasm resource; Strategy for improvement. 韩微波,刘录祥,郭会君,赵林姝,王成社. 2005

[12]Efficient agronomic practices narrow yield gaps and alleviate climate change impacts on winter wheat production in China. Kaiyuan Gong,Liangbing Rong,Yinghua Zhang,Xiao Wang,Fengying Duan,Xia Li,Zhihao He,Tengcong Jiang,Shang Chen,Hao Feng,Qiang Yu,Wenbin Zhou,Jianqiang He. 2025

[13]DeepWheat: predicting the effects of genomic variants on gene expression and regulatory activities across tissues and varieties in wheat using deep learning. Zhigang Ma,Jiazi Zhang,Hongcui Pei,Yanhong Liu,Hongning Tong,Lei Wang,Zefu Lu. 2025

[14]苹果蠹蛾8个烟碱型乙酰胆碱受体基因的克隆与生物信息学分析. 郭金梦,罗嘉鹏,冯丽凯,李飞,林克剑,王桂荣. 2018

[15]柑橘黄化脉明病毒的TGB基因生物信息学分析及亚细胞定位. 崔甜甜,王艳娇,李中安,周常勇,宋震. 2017

[16]ghr-miR160负调控棉花叶片衰老机理研究. 段珊,窦玲玲,程帅帅,郭亚宁,庞朝友,马启峰,魏恒玲,范术丽,王寒涛,喻树迅. 2018

[17]甘蔗蔗糖转运蛋白SoSUT5基因克隆、表达及功能鉴定. 牛俊奇,苗小荣,王道波,杨丽涛,李杨瑞. 2018

[18]奶水牛固醇携带蛋白2基因克隆、生物信息学分析及其组织表达检测. 梁莎莎,庞春英,邓廷贤,马小娅,陆杏蓉,段安琴,梁贤威. 2018

[19]水牛甲状旁腺素1受体基因CDS区克隆与生物信息学分析. 陆杏蓉,梁贤威,梁莎莎,邓廷贤,段安琴,马小娅,庞春英. 2018

[20]牦牛A-FABP基因的克隆与生物信息学分析. 秦文,阎萍,裴杰,吴晓云,李天科. 2013

作者其他论文 更多>>