文献类型： 中文期刊
作者： 刘晓雨;张红;黄慧;范亚朋;张悦新;刘孟月;陈文华;韩明格;姜田田;冯茜贤;雷宇茜;尼克松;陈修贵;王德龙;陈超;陈全家;叶武威
作者机构：
关键词： 陆地棉;脱落酸醛氧化酶;基因克隆;生物信息学分析
期刊名称：分子植物育种
ISSN： 1672-416X
年卷期： 2023 年
页码：
收录情况： 北大核心（2020版） ; ; 科技核心（2023版） ; ; 农林核心（2020版）
摘要： 为了解棉花如何响应NaHCO3胁迫，本研究以陆地棉“中9807”为实验材料，利用从前期获得的125mmol/L NaHCO3处理三叶一心期棉花12h的转录组测序结果中筛选得到差异表达基因Gh＿A09G0970，利用RT-PCR对该基因进行克隆，通过生物信息学分析对该基因的编码蛋白的理化性质、亲水性与疏水性，对磷酸化和糖基化位点、信号肽和跨膜区以及蛋白质结构进行预测。结果表明，该基因编码区全长为1809 bp，编码602个氨基酸，存在磷酸化和O-糖基化位点，该基因编码的蛋白质二级结构主要包括α-螺旋、延伸链、β-转角和无规卷曲这4个元件，该蛋白为疏水性蛋白，不存在明显的信号肽不属于跨膜蛋白，亚细胞定位发现该基因主要存在于细胞质膜中，构建系统进化树发现GhAAO2和海岛棉的亲缘关系最近，并分析用不同浓度的NaHCO3处理棉花，GhAAO2基因在叶片中的表达结果，发现该基因在NaHCO3胁迫下呈下调表达趋势，为探索棉花NaHCO3胁迫响应机制提供理论参考。
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