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盐胁迫下老芒麦叶片转录组SSR位点信息分析

文献类型： 中文期刊

作者： 李德珍;德英;穆怀彬;闫伟红;胡哲华

作者机构：

关键词： 盐胁迫;老芒麦叶片;转录组;SSR位点信息

期刊名称：中国草地学报

ISSN： 1673-5021

年卷期： 2025 年 47 卷 06 期

页码：

收录情况： 北大核心（2023版） ; ; CSCD（2025-2026年度） ; ; 科技核心（2024版） ; ; 农林核心（2024版）

摘要： 老芒麦是退化草地生态治理和草牧业中广泛应用的优良草种。本研究以中草28号老芒麦为研究对象，在250 mmol/L NaCl盐溶液胁迫0、2、4、6、12 h时取叶片进行转录组测序分析。结果表明，共获得149556条Unigenes序列，总序列长为130384898 bp;SSR位点信息分析显示，13299条Unigenes序列中含有16446个2～6个碱基的SSR重复序列，平均距离7928 bp,SSR的发生频率为8.89%，出现频率为11.00%。其中：三核苷酸重复SSRs序列是最主要的类型，占比55.22%，出现频率为6.07%；其次是二核苷酸重复SSRs序列，占比25.21%，出现频率为2.77%。SSRs基元的重复次数主要集中在4～7次，占比85.65%。SSRs位点包含279种重复基元，其中CCG/CGG重复基元数量最多，占总数的18.78%；其次是AG/CT重复基元，占总数的15.10%。重复序列长度≥20 bp的SSRs位点有5688个，占总数的34.59%。综上，盐胁迫下老芒麦叶片转录组中SSR位点表现出较高的多样性和多态性潜能，为老芒麦的遗传多样性研究、分子标记辅助育种提供了重要的标记资源。

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