数字农科院2.0

大豆BADH基因的生物信息学、多样性及功能分析

文献类型： 中文期刊

作者： 张永芳;李富恒;吕怡杰;邱丽娟

作者机构：

关键词： 大豆;BADH1;BADH2;单倍型特性分析;结构;突变位点;芳香性;

期刊名称：大豆科学

ISSN： 1000-9841

年卷期： 2021 年 40 卷 01 期

页码：

收录情况： CSCD（2020-2021年度） ; 农林核心（2020版） ; 科技核心（2020版）

摘要： 为研究大豆中甜菜碱醛脱氢酶(BADH)在大豆中的分子机理及生物多样性,通过基因序列同源比对搜索到两个与水稻同源的大豆BADH基因,利用Phytozome、Netphosk 3.0 Server等网站及数据库对其进行生物信息学分析,结合已有的重测序数据分析1 598份大豆种质中BADH基因序列的多态性,并测定突变体的2AP含量。结果表明:大豆中有两个与水稻BADH基因同源性较高的基因序列Gm06g186300和Gm 05g0330550,基因全长分别为3 959和6 008 bp,编码蛋白均属于稳定蛋白质,二者同源性高达90%。两个蛋白的氨基酸数目、分子量和等电点等非常相似;亲水性和磷酸化位点分布较一致,均无跨膜结构域,在细胞核出现的可能性最大,且二者进化关系极其相近;α螺旋和无规则卷曲是两者的主要成分,BADH1和BADH2有1个共同的结构域Pfam-Aldedh,且分布大致相同。对1 598份大豆种质BADH基因序列突变位点进行分析,有29份材料BADH2基因发生6个碱基序列突变导致了移码突变,这种突变可能与大豆的芳香性表型有关。对BADH1及BADH2在大豆不同部位的基因表达量分析发现各部位的表达量相差很大,均以根部表达量最高,可能与根部较高的抗旱能力有关。

分类号：

  • 相关文献

[1]关于大豆优质高产问题的研讨. 王连铮. 2002

[2]MSTN基因突变对优质鸡肌肉生长的影响. 赵振华,黎寿丰,黄华云,李春苗,王钱保,薛龙岗. 2015

[3]TRHDE基因多态性与乌珠穆沁羊生长性状的关联分析. 尚明玉,毕亚珍,胡文萍,张莉. 2023

[4]利用CRISPR/CAS9技术编辑水稻香味基因Badh2. 邵高能 , 谢黎虹 , 焦桂爱 , 魏祥进 , 圣忠华 , 唐绍清 *, 胡培松 *. 2017

[5]利用CRSPR/Cas9技术创制抗稻瘟病香型早籼温敏核不育系. 梁敏敏,张华丽,陈俊宇,戴冬青,杜成兴,王惠梅,马良勇. 2022

[6]Pyramiding Rice Blast Resistance Gene Pi2 and Fragrance Gene badh2. Yakun Wang,Shengjia Tang,Naihui Guo,Ruihu An,Zongliang Ren,Shikai Hu,Xiangjin Wei,Guiai Jiao,Lihong Xie,Ling Wang,Ying Chen,Fengli Zhao,Shaoqing Tang,Peisong Hu,Zhonghua Sheng. 2023

[7]Soybean CHX-type ion transport protein GmSALT3 confers leaf Na+ exclusion via a root derived mechanism, and Cl− exclusion via a shoot derived process. Yue Qu, Rongxia Guan,Jayakumar Bose, Sam W. Henderson,Stefanie Wege, Lijuan Qiu, Matthew Gilliham. 2021

[8]Development of the Soybean Industry in Africa:Safeguarding Security in Africa and China-A Perspective. 宁库阿,韩天富,费利克斯.达科拉. 2025

[9]县域秸秆燃料化利用模式分析与发展建议. 陈明江,高庆生,曲浩丽,陈永生,王燕. 2015

[10]金砖国家一般服务支持政策比较研究. 王禹,李哲敏,吴培,张超. 2017

[11]龙胆多糖的结构表征及其体外免疫活性. 曹荣安,徐秀丽,苗家尉,郭增旺,李良玉,贾建,王长远. 2017

[12]近代女性倒大袖上衣的衣身造型研究. 宋雪,崔荣荣. 2017

[13]2001-2016年马铃薯生产成本结构及其变化趋势研究. 王秀丽,刘润雅,马云倩,孙君茂. 2019

[14]改革开放以来我国稻田种植制度的变革. 张伯平. 2002

[15]2BYS-6型水田中耕除草机设计与试验. 吴崇友,张敏,金诚谦,涂安富,卢晏,肖体琼. 2009

[16]不同类型水稻支链淀粉理化特性及其与米粉糊化特征的关系. 蔡一霞,王维,朱智伟,张祖建,杨建昌,朱庆森. 2006

[17]非圆齿轮机构水稻毯状苗浅栽机. 金诚谦,吴崇友,涂安富,卢晏. 2005

[18]大白菜、甘蓝和黑芥CBL1基因的比较分析. 李化银,姜常松,张一卉,高建伟,李利斌,曹齐卫. 2014

[19]‘豫大籽’与‘突尼斯’石榴的种子结构及硬度比较. 薛辉,曹尚银,陈利娜,李好先,牛娟,张富红,赵弟广. 2016

[20]植物内切β-1;4-葡聚糖酶基因研究进展. 柴国华,付先虎,白泽涛,黄军艳,刘胜毅. 2009

作者其他论文 更多>>