数字农科院2.0

基于转录组测序筛选蒙古冰草抗旱相关基因

文献类型： 中文期刊

作者： 樊璐;唐俊;马琳;张志鹏;蒋庆雪;李俄仁措;马巧玲;王学敏;赵威

作者机构：

关键词： 蒙古冰草;干旱;三代全长转录组;二代转录组测序;转录因子

期刊名称：草地学报

ISSN： 1007-0435

年卷期： 2024 年

页码：

收录情况： 北大核心（2023版） ; ; CSCD（2023-2024年度） ; ; 科技核心（2024版） ; ; 农林核心（2020版）

摘要： 为挖掘蒙古冰草（Agropyron mongolicum Keng）抗旱相关基因并探究蒙古冰草响应干旱胁迫分子机制，本研究以蒙古冰草为材料进行转录组测序。首先将不同生长期及干旱胁迫处理后的盆栽蒙古冰草组织按照根、茎、叶、花（穗）4类分别进行混样并利用三代全长转录组测序技术建立蒙古冰草转录本参考序列数据库，共获得26 027条转录本，包含25 578个基因，利用BlastX在KEGG，KOG，Nr，Swissprot等数据库中进行比对注释，共有25 453个转录本得到注释。其次利用二代转录组测序技术对干旱胁迫处理前后水培蒙古冰草幼苗进行测序，发现干旱胁迫处理2 h，6 h后与处理前相比分别有2 669个、3 668个差异表达基因。此外，根据转录组及荧光定量PCR验证结果，发现基因ERF053，ERF055，NAC100，bZIP23，ERF5和NAM-B1在干旱处理后表达量较高且均上调可能是抗旱调控关键基因，为后续蒙古冰草抗旱相关候选基因克隆及功能验证奠定了基础。

分类号：

  • 相关文献

[1]两种冰草属植物光合生理特性研究. 闫伟红,徐柱,马玉宝,李临杭. 2010

[2]蒙古冰草与航道冰草杂交F1代染色体加倍植株过氧化物同工酶分析. 郝峰,刘翠玲,郝水源. 2010

[3]蒙古冰草研究概况. 张众,师文贵,逯晓萍. 2004

[4]蒙古冰草对狼毒化感作用的抗性. 王慧,周淑清,黄祖杰,刘一凌,胡卉芳. 2008

[5]我国北方9份旱生—沙生植物蒙古冰草遗传多样性研究. 李晓全,高有汉,刘扬,索培芬,韩冰. 2016

[6]蒙古冰草的遗传多样性研究. 车永和,杨欣明,杨燕萍,李秀全,李立会. 2011

[7]蒙古冰草SSR遗传完整性分析中适宜样本量及标记数量筛选. 迟恩惠,李俊,李鸿雁,黄帆,米福贵. 2019

[8]蒙古冰草(Agropyron mongolicum)落粒相关基因Amsh1克隆及进化分析. 田青松,高金玉,融晓萍,张瑞霞,韩冰,索培芬,李晓全. 2018

[9]蒙古冰草居群遗传多样性研究. 兰保祥,李立会,王辉. 2005

[10]硅提高植物耐旱性研究进展. 刘铎,李平,杨庆山,梁志杰,郭魏,齐学斌. 2019

[11]入侵杂草薇甘菊与本地植物粉葛对水分胁迫的生理响应. 王家宜,余涵霞,赖玉芳,万方浩,钱万强,彭长连,李伟华. 2017

[12]干旱条件下DCMU对高表达转C_4-pepc水稻的花青素合成基因及其相关信号的影响. 何亚飞,许梦洁,李霞. 2018

[13]水分胁迫对不同耐旱性玉米土壤水分消耗、水分利用和产量的影响. 蒿宝珍,马静丽,方保停,姜丽娜,赵凌霄,翁正鹏,朱娅林. 2019

[14]干旱胁迫对玉米叶片光合特性和穗发育特征的影响. 贾双杰,李红伟,江艳平,赵国强,王和洲,杨慎骄,杨青华,郭家萌,邵瑞鑫. 2020

[15]旱涝交替胁迫对粳稻分蘖期叶片解剖结构的影响. 陆红飞,郭相平,甄博,乔冬梅,周新国,王振昌,刘春成,杨泊. 2017

[16]外源葡萄糖增强高表达转玉米C_4型pepc水稻耐旱性的生理机制. 张金飞,李霞,何亚飞,谢寅峰. 2018

[17]干旱胁迫下调节ATP的含量对提高转玉米C_4型pepc水稻光合速率的影响. 霍垲,陆巍,李霞. 2015

[18]人民胜利渠灌区净灌溉需水量时空变异及影响因子分析. 常迪,黄仲冬,齐学斌,韩洋,梁志杰. 2017

[19]胶东地区不同麦田燕麦孢囊线虫群体发生量比较及差异分析. 张广菊,赵洪海,彭德良. 2017

[20]近30年中国玉米气候生产潜力时空变化特征. 钟新科,刘洛,徐新良,游松财. 2012

作者其他论文 更多>>