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一株高产脂肪酶菌株WCO-9全基因组测序及比较基因组分析

文献类型： 中文期刊

作者： 张泽颖;范清锋;邓云峰;韦廷舟;周正富;周建;王劲;江世杰

作者机构：

关键词： 脂肪酶;琼氏不动杆菌;全基因组测序;基因功能注释;比较基因组学

期刊名称：生物技术通报

ISSN： 1002-5464

年卷期： 2022 年

页码：

收录情况： 北大核心（2020版） ; CSCD（2021-2022年度） ; 科技核心（2021版） ; 农林核心（2020版）

摘要： 琼氏不动杆菌WCO-9是从油污污染的土壤中分离的一株高产脂肪酶菌株，所产脂肪酶具有显著优于对照同种菌株ATCC 17908的水解活性，为探究WCO-9菌株高效产酶机制，挖掘新型特异脂肪酶功能基因，采用Oxford Nanopore技术完成WCO-9菌株的全基因组测序，并对同属菌株进行比较基因组学分析。结果显示，脂肪酶产生菌WCO-9的基因组大小为3.19 Mb,GC含量38.62%，含有2 929个编码基因，其中包含11个脂肪酶编码基因（1个特异基因）和3个脂肪酶分子伴侣基因；共线性分析也说明WCO-9菌株基因组与对照菌株ATCC 17908具有显著差异。WCO-9菌株全基因组序列分析对该菌的高效产酶机制研究及新型脂肪酶特异基因挖掘具有重要意义，为后期高产脂肪酶工程菌的创制及工业化应用提供理论基础。

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