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玉米Gln1-3 gDNA序列分离、基因结构、保守功能域与等位变异分析

文献类型： 中文期刊

作者： 吴永升;李新海;张征;李明顺;郝转芳;张世煌;谢传晓

作者机构：

关键词： 玉米;Gln1-3基因;功能域;单核苷酸多态性;氮利用效率;关联性分析

期刊名称：作物学报

ISSN： 0496-3490

年卷期： 2008 年 34 卷 07 期

页码： 1114-1120

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 谷氨酰胺合成酶家族是高等植物体内氨态氮同化酶,是植物体内氮利用与循环的核心构件。玉米Gln1-3基因编码叶肉细胞中的细胞质同工酶,与全株氮向籽粒蛋白质同化与氮利用效率及产量紧密相关。本研究以玉米自交系辽白371为材料,采用PCR与接头步移(walking)方法分离得到Gln1-3基因区域基因组DNA(gDNA)全长4571bp,起始密码子至终止密码子序列长3062bp。将该基因在GenBank注册,登录号为EU338535,并进行了详细注释。该基因由10个外显子、9个内含子组成,剪接方式主要为5′供位保守的GU与3′受位AG模式。编码的GS1蛋白由356个氨基酸组成,分子量39.2kD,等电点(pI)为5.202。保守功能域分析表明,氨基末端外显子2到外显子6为氨离子结合结构域,羧基末端外显子8与外显子9构成ATP酶结构域,在胞内行使催化功能。对50个玉米自交系Gln1-3基因重要分析区域进行了等位变异分析,鉴定出364个等位变异,其中313个为SNP变异,占86%。

分类号： S513

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