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西瓜核心种质耐盐性的全基因组关联分析

文献类型： 中文期刊

作者： 袁高鹏;赵彦龙;孙德玺;高博文;李卫华;时明坤;张靖宇;朱迎春

作者机构：

关键词： 西瓜;耐盐性;全基因组关联分析;单核苷酸多态性;基因挖掘

期刊名称：果树学报

ISSN： 1009-9980

年卷期： 2024 年

页码：

收录情况： 北大核心（2023版） ; ; CSCD（2023-2024年度） ; ; 科技核心（2024版） ; ; 农林核心（2020版）

摘要： 【目的】挖掘西瓜耐盐相关的关键候选基因，为探究西瓜应答盐胁迫的机制、培育耐盐西瓜新品种奠定重要基础。【方法】通过对121份西瓜核心种质材料的耐盐性相关指标进行测定，利用全基因组关联分析（genome-wide association study，GWAS）对表型指标进行分析，定位与表型数据相关的单核苷酸多态性（Single Nucleotide Polymorphisms，SNPs）变异位点，并对候选区间内的基因进行功能注释，最终利用耐盐材料和盐敏感材料的转录组数据确定耐盐相关的关键候选基因。【结果】在根表面积指标下鉴定出1个显著SNP位点，在候选区间内获得23个基因；在根K+含量指标下鉴定出25个显著SNP位点，在候选区间内获得25个基因；在根Na+含量指标下鉴定出2个显著SNP位点，在候选区间内获得10个基因；在根可溶性糖含量指标下鉴定出1个显著SNP位点，在候选区间内获得18个基因。所有区间内候选基因在150 mmol·L-1 NaCl处理前后的耐盐品种和盐敏感材料中，Cla97C08G145130、Cla97C0...

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