口蹄疫病毒A/WH/09株结构蛋白P1基因的克隆及其B细胞抗原表位的预测
文献类型: 中文期刊
作者: 娄慧;张中旺;陈启伟;张永光
作者机构:
关键词: 口蹄疫病毒;结构蛋白P1;测序;B细胞抗原表位
期刊名称:中国兽医科学
ISSN: 1673-4696
年卷期: 2011 年 03 期
页码: 221-228
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 对口蹄疫病毒(FMDV)A/WH/09株P1结构蛋白基因进行了扩增、克隆及序列测定。结果显示,FMDV A/WH/09株P1基因长2 208bp,包含完整的开放阅读框,编码736个氨基酸,其中VP1长636bp,编码212个氨基酸;VP2长654bp,编码218个氨基酸;VP3长663bp,编码221个氨基酸;VP4长255bp,编码85个氨基酸。采用DNAStar Protean软件对P1蛋白的二级结构、可塑性、亲水性、表面可及性及抗原指数等参数进行了综合分析,并预测其B细胞的抗原表位分布。结果表明,VP1、VP2和VP3上均有多个区域为B细胞抗原优势表位,VP4上也有少量潜在的B细胞抗原表位。与已鉴定的B细胞抗原表位相比,本试验所用方法预测的结果有较高的准确度,是一种较为先进的表位研究方法。
分类号: S852.659.6
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