文献类型： 中文期刊
作者： 陈欣雨;王圣楠;王丹丹;马月辉;蒋琳;刘书琴
作者机构：
关键词： ZBED6基因;基因敲除;转录组分析;肺脏;巴马香猪
期刊名称：中国畜牧兽医
ISSN： 1671-7236
年卷期： 2025 年 12 期
页码：
收录情况： 北大核心（2023版） ; ; CSCD（2025-2026年度） ; ; 科技核心（2024版） ; ; 农林核心（2024版）
摘要： 【目的】研究ZBED6基因敲除对巴马香猪肺脏基因表达谱的影响,进一步明确ZBED6基因缺失对巴马香猪肺脏功能的影响。【方法】采集8月龄雌性野生型（WT）和ZBED6基因敲除型（ZBED6-KO）巴马香猪肺脏组织并称重,用Trizol法提取肺脏组织RNA,经质量检测后建库(NEBNext? UltraTM)并测序（Illumina HiSeq 2500）。数据经Fastp v 0.23.4质控,TopHat和Cufflink分析差异基因,以|log2FoldChange|≥1和P≤0.05为标准筛选出差异表达基因。利用g:Profiler在线数据库对差异表达基因进行富集分析,利用实时荧光定量PCR对转录组测序（RNA-Seq）结果进行验证。【结果】与WT型巴马香猪相比,ZBED6-KO型巴马香猪的肺脏重量无显著变化（P>0.05）。利用转录组测序在WT和ZBED6-KO型巴马香猪肺脏组织中共筛选出480个差异表达基因,其中上调基因125个,下调基因355个。上调基因主要富集在2条与免疫相关的通路,下调基因主要富集在代谢相关通路中。实时荧光定量PCR验证结果显示,上调和下调基因的表达变化趋势与RNA-Seq结果一致,证实了RNA-Seq数据的可靠性。【结论】ZBED6基因敲除影响了巴马香猪肺脏组织的基因表达谱,其中免疫相关基因普遍上调,而代谢相关基因显著下调。本研究结果为ZBED6在肺脏组织中的功能与作用提供更多的理论支持和证据,进一步填补了转录因子ZBED6在哺乳动物中肺脏方面作用机制的研究空白。
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