渗透胁迫下水稻根系核仁小分子RNA转录本变化的全基因组表达分析
文献类型: 中文期刊
作者: 马廷臣;陈荣军;余蓉蓉;曾汉来;张端品
作者机构:
关键词: 基因芯片;水稻;根系;核仁小分子RNA;转录本;干旱胁迫
期刊名称:中国水稻科学
ISSN: 1001-7216
年卷期: 2012 年 26 卷 01 期
页码: 16-20
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 利用Affymetrix水稻60k芯片研究了聚乙二醇6000(PEG)模拟干旱时,水稻根系核仁小分子RNA(snoRNA)转录本的表达活性变化。在模拟干旱胁迫下,水稻根系snoRNA转录本表达有很强的品种特异性,干旱敏感品种爱华5号中共有23个snoRNA转录本活性发生变化且均表现为上调表达,而耐旱品种湘丰早119中仅有2个snoRNA转录本表达活性发生变化,也都为上调表达;转录活性发生变化的snoRNA转录本都为C/D框型,且在染色体上存在5处snoRNA簇;爱华5号和湘丰早119在模拟干旱胁迫下表达发生变化的snoRNA转录本有1个转录本重叠,且此转录本在爱华5号中表达活性是湘丰早119中的17.54倍。
分类号: S511
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