数字农科院2.0

北京黑猪与杜洛克猪肌内脂肪沉积相关基因的筛选

文献类型： 中文期刊

作者： 白云华;王立贤;陈华林;麻柱;杨超;路永强;王楚端;黄全奎;邢凯;王朝军;薛振华

作者机构：

关键词： 北京黑猪;杜洛克猪;背最长肌;肌内脂肪;转录组

期刊名称：中国畜牧杂志

ISSN： 0258-7033

年卷期： 2024 年

页码：

收录情况： 北大核心（2023版） ; ; CSCD（2023-2024年度） ; ; 科技核心（2024版） ; ; 农林核心（2020版）

摘要： 本研究旨在鉴定北京黑猪与杜洛克猪背最长肌（LDM）组织中的差异表达基因（DEGs），筛选影响猪肌内脂肪（Intramuscular Fat，IMF）沉积的关键基因及通路。本研究共选取北京黑猪和杜洛克猪各6头，采集其背最长肌组织，提取RNA并进行转录组测序。将测序数据进行比对、定量后，利用DESeq2筛选差异表达基因(|log2FC|≥1，P<0.05)并进行GO分析和KEGG分析。结果表明：2个品种猪背最长肌组织中共检测到206个差异表达基因，其中，100个基因在北京黑猪肌肉组织中高表达，106个基因在杜洛克猪肌肉组织中高表达。差异表达基因显著富集在24条通路，其中AMPK信号通路、PPAR信号通路、Wnt信号通路、不饱和脂肪酸的生物合成、脂质和动脉粥样硬化和脂肪酸代谢等通路参与了脂肪生成和代谢的过程。经进一步分析，ELOVL6、FASN、SCD、SQLE和NR4A1等基因在肌内脂肪生成的过程中发挥关键作用。该研究结果为猪肌内脂肪沉积的分子调控机制提供了参考。

分类号：

  • 相关文献

[1]基于转录组测序的巴马香猪和杜洛克猪骨骼肌差异lncRNA分析. 胡梦灵,范新浩,姚一龙,闫超,谢炳坤,兰干球,梁晶,唐中林. 2024

[2]利用超声波图像活体预测北京黑猪肌内脂肪含量. 马小军,程笃学,王立刚,刘欣,宋欣,梁晶,张龙超,颜华,王立贤,陈来华,谢蜀杨. 2012

[3]北京黑猪肌内脂肪含量高、低组间脂质组差异分析. 张润,刘海,杨曼,张龙超,王源. 2022

[4]基于转录组分析挖掘平凉红牛背最长肌肉质性状候选基因. 王文翔,杜丽丽,张路培,高雪,徐凌洋,李俊雅,高会江. 2023

[5]基于GWAS及双选系胚胎基因表达差异联合分析鉴定北京黑猪胸椎数主效基因. 赵润泽,闵兆玲,牛乃琪,宗文成,闫益波,张龙超. 2025

[6]Stage‐specific transcriptome profiling highlights key modules associated with structurally conserved secreted proteins in Puccinia polysora infection of maize. Yuanwen Guo, Yuyan Liu, Jie Mei, Zeyu Jiao, Yan Yang, Wende Liu. 2025

[7]北美猪的育种体系. 王立贤,程笃学. 2005

[8]杜洛克猪饲料利用效率性状的遗传参数估计及其相关性分析. 蒲蕾,张龙超,王立刚,施辉毕,王立贤. 2015

[9]杜洛克猪HMGA1基因多态位点与生长、饲料利用性状的关联分析. 蒲蕾,刘欣,岳静伟,张金山,王立刚,颜华,侯欣华,高红梅,张恬,张跃博,武群清,张龙超,王立贤. 2016

[10]杜洛克猪MAP3K5基因多态位点与生长、饲料利用性状的关联分析. 蒲蕾,岳静伟,张金山,刘欣,王立刚,颜华,侯欣华,高红梅,张恬. 2016

[11]杜洛克猪饲料利用效率测定阶段及RFI校正公式研究. 张金山,王立刚,张跃博,张龙超,王立贤. 2019

[12]杜洛克猪HLCS基因多态位点与生长发育性状的相关性分析. 蒲蕾,代宇星,张跃博,张龙超,郭亮,王立贤. 2020

[13]甜高粱和玉米青贮对肉羊肌纤维组织及其 相关肉质性状的影响. 王婷,侯明杰,尚占环,王虎成. 2018

[14]日粮维生素A水平对肉牛肝脏和肌肉维生素A和E含量的影响. 张丽萍,王加启,雒秋江,张幸开,万发春. 2005

[15]育成期日粮营养对育肥皖南牛背最长肌部位肉常规营养物质含量的影响. 张兴隆,杨永在,王长水,曹兵海. 2015

[16]欧拉型藏羊肉理化及近红外光谱特性研究. 王振宇,王培培,陈丽,饶伟丽,张德权. 2012

[17]深度测序鉴定绵羊microRNA转录组. 张世芳,魏彩虹,陆健,张小宁,周鑫磊,张淑珍,王光凯,曹家雪,赵福平,张莉,杜立新. 2013

[18]腌制时间对牦牛臂肌四头肌和背最长肌食用品质的影响. 王莉,张丽,孙宝忠,周玉春,黄彩霞,王春晓,刘璇. 2014

[19]青海高原牦牛PRDM16基因克隆、生物信息学及组织差异表达分析. 赵生军,张勇,郭宪. 2016

[20]长途运输应激对西门塔尔牛不同部位肉品质指标的影响. 雷元华,杨媛丽,张松山,李素霞,谢鹏. 2018

作者其他论文 更多>>