2株羊源利奈唑胺耐药肠球菌的基因组性状分析
文献类型: 中文期刊
作者: 蒋春燕;何英俊;李嘉豪;赵丽丽;张超颖;兰新财;李涛
作者机构:
关键词: 肠球菌;利奈唑胺;耐药性;基因组;耐药基因;毒力因子
期刊名称:南方农业学报
ISSN: 2095-1191
年卷期: 2025 年
页码:
收录情况: 北大核心(2023版) ; ; CSCD(2025-2026年度) ; ; 科技核心(2024版) ; ; 农林核心(2024版)
摘要: 【目的】检测羊场肠球菌利奈唑胺耐药情况,了解羊源利奈唑胺耐药肠球菌基因组性状,为羊场后续用药提供理论指导和技术支撑。【方法】对来自羊场的样品采取划线培养,挑取单菌落。参照CLSI2024方法检测平板上分离的单菌对养殖场常见抗生素药物敏感度及利奈唑胺最小抑菌浓度,利用细菌基因组高通量测序技术和生物信息学平台,解析目标菌株耐药基因、MLST分型、毒力基因等基因组性状。【结果】分离得到2株利奈唑胺耐药肠球菌,为粪肠球菌(命名为SEF21113)和耐久肠球菌(命名为SED21251)。SEF21113的染色体全长3021973 bp,共编码2949个基因,不含有质粒;SED2151的染色体全长2734323 bp,共编码2760个基因,同样不含有质粒。SEF21113的基因组含有228个碳水化合物代谢基因和64个能量代谢基因,同时菌株编码214个膜运输系统相关基因及54个遗传信息处理相关基因;SED21251虽然也保留了较高的碳水化合物代谢潜力,但其能量代谢通路基因数量相对减少(58个基因)。此外,SEF21113和SED21251分别含有6个耐药基因、12个耐药基因,且2株菌的optrA耐药基因均位于染色体可移动转移元件中间区域,其上下游伴随多个假定蛋白及铁氧化还原蛋白编码基因。MLST分型结果显示SEF21113为ST207型,与比利时分离株亲缘关系最近。2株分离菌均携带与生物膜形成、组织黏附及免疫逃逸相关的毒力基因,具有较强的生物膜形成和细胞粘附能力。【结论】从羊场分离出2株利奈唑胺耐药肠球菌,均携带多种耐药基因和毒力因子。其利奈唑胺耐药基因侧翼存在可移动遗传元件,提示可能通过水平转移获得耐药性。基因组分析表明菌株经历多次重组,具备较强环境适应性与潜在致病性,提示羊场耐药菌可能经食物链传播至人类,构成公共卫生风险。
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