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赤霉素诱导甘蔗节间伸长基因的cDNA-SCoT差异表达分析

文献类型： 中文期刊

作者： 吴建明;李杨瑞;王爱勤;杨柳;杨丽涛

作者机构：

关键词： 赤霉素;甘蔗;cDNA-SCoT;差异表达

期刊名称：作物学报

ISSN： 0496-3490

年卷期： 2010 年 36 卷 11 期

页码： 1883-1890

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 以甘蔗ROC22为材料,在伸长初期进行叶面喷施200mgL?1浓度的赤霉素为处理,以喷施清水为对照,在不同时间取幼茎样品,用cDNA-SCoT进行基因差异表达分析。结果表明,通过46条引物筛选了约700个cDNA片段,获得差异片段30个。有18个基因片段受赤霉素上调而12个基因片段下调;其中16个TDFs序列和NCBI数据库中已录入的基因具有较高的相似性,按照其功能可分为6类,即能量与代谢相关基因(占总数的20.0%)、未知功能蛋白(占总数的20.0%)、未知基因(占总数的46.7%)、信号传导相关基因(占总数的6.7%)、转录因子相关基因(占总数的3.3%)和细胞凋亡基因(3.3%)。这说明利用SCoT方法可以进行蔗茎基因差异表达研究,分离到的一些差异片段可能是与甘蔗节间伸长相关的基因。

分类号： S566.1

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