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毛竹硅转运基因PhLsi1的ORF克隆及生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

作者： 马欢;王凯;吴妙丹;赵宝华

作者机构：

关键词： 毛竹;硅;内转运蛋白;生物信息学

期刊名称：河北师范大学学报(自然科学版)

ISSN： 1000-5854

年卷期： 2015 年 04 期

页码： 345-351

收录情况： 北大核心

摘要： 以水稻硅的内转运蛋白基因Lsi1的cDNA序列为信息探针,对毛竹的核酸数据库进行同源性搜索,获得全长为797bp的毛竹硅内转运蛋白基因的cDNA序列(Genbank登陆号:FP095571).与水稻Lsi1的cDNA序列相比,毛竹中该基因cDNA序列第721位处发生终止突变,导致毛竹Lsi1丢失了86个氨基酸残基.采用RTPCR方法对其进行克隆,序列分析表明,PhLsi1基因在编码时确实存在提前终止现象,共编码212个氨基酸,与水稻、玉米和大麦中已克隆的硅内转运蛋白(silicon influx transporter,含有6个跨膜螺旋区和2个NIP保守基序)的序列相似性分别高达99.3%,91.9%,91.9%,但只具有5个跨膜螺旋区和1个NIP保守基序.

分类号： Q943.2`Q811.4

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