数字农科院2.0

牛活检胚胎细胞微量扩增体系效果评估

文献类型： 中文期刊

作者： 牛一凡;李崇阳;张培培;张航;冯肖艺;余洲;曹建华;杜卫华;万鹏程;马友记;赵学明

作者机构：

关键词： 华西牛;活检胚胎;扩增体系;效果比较

期刊名称：畜牧兽医学报

ISSN： 0366-6964

年卷期： 2024 年

页码：

收录情况： 北大核心（2023版） ; ; CSCD（2023-2024年度） ; ; 科技核心（2024版） ; ; 农林核心（2020版）

摘要： 旨在通过二代测序技术评估不同单细胞全基因组扩增体系对不同胚胎细胞数量的扩增效率。本研究选择同一饲养管理条件下、体况良好的华西牛母牛为供体，采用FSH法超数排卵后进行人工授收集第7天胚胎，通过活检技术获得含1细胞（cell，C）、5 C、10 C胚胎细胞样本用于全基因组扩增（whole genome amplification），随后通过全基因组重测序（whole genome sequencing）技术评估单细胞基因组扩增体系扩增效率的差异。结果显示，在1C和5C样本中多重置换扩增（multiple displacement amplification ，MDA）体系的扩增成功率优于多次退火环状循环扩增（multiple annealing and looping-based amplification cycles，MALBAC）体系（100% vs. 60%，100% vs. 80%，P<0.05），此外MDA体系的扩增产物总量极显著高于MALBAC体系（P<0.01）；基于测序分析指标：正确比对率、重复率、分型一致率、等位基因缺失率、假阳性率等，MALBAC体系优于MDA体系；全同胞样品的分型一致率大于半同胞样品的分型一致率，但不同全同胞、半同胞胚胎样本之间的分型一致率有很大差异。综上所述，MDA和MALBAC体系各具特点，结合两者优势可能是改进扩增效率的途径之一，本研究为牛早期胚胎全基因组选择研究和促进牛育种发展提供一定理论基础。

分类号：

  • 相关文献

[1]华西牛新品种培育及对我国肉牛育种的启示. 张天留,王泽昭,朱波,陈燕,张路培,徐凌洋,高会江,高雪,李俊雅. 2023

[2]育肥期华西牛蛋白质与能量需要量研究. 张莹,吴兆海,卜登攀. 2022

[3]不同筛选方法的低密度SNP集合填充准确性比较. 林雨浓,王泽昭,陈燕,朱波,高雪,张路培,高会江,徐凌洋,蔡文涛,李英豪,李俊雅,高树新. 2023

[4]华西牛胴体及原始分割肉块重量性状遗传参数估计与全基因组关联分析. 李柯安宁,杜丽丽,安炳星,邓天宇,梁忙,曹晟,杜悦莹,徐凌洋,高雪,张路培,李俊雅,高会江. 2023

[5]华西牛胴体性状GWAS分析. 高翰,葛菲,王泽昭,李宏伟,安炳星,李海鹏,徐凌洋,朱波,蔡文涛,张路培,高雪,高会江,陈燕,李俊雅. 2022

[6]华西牛与雪龙黑牛背最长肌重量的全基因组关联分析. 杜悦莹,安炳星,邓天宇,杜丽丽,梁忙,李柯安宁,曹晟,高会江,闵令江. 2024

[7]肉牛培育品种遗传资源价值评估研究——以华西牛为例. 马卓,李宏伟,浦华. 2025

[8]华西牛群体生长发育性状遗传参数估计及其遗传进展. 曹晓瑶,汪聪勇,王亭,熊兰玲,于河洋,王泽昭,高会江,李俊雅,朱波. 2025

[9]不同芯片密度对华西牛重要经济性状基因组评估准确性的影响. 王元清,王泽昭,朱波,陈燕,徐凌洋,张路培,高会江,李超,李俊雅,高雪. 2024

作者其他论文 更多>>