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醋栗番茄染色体水平基因组组装

文献类型： 中文期刊

作者： 刘志强;蔡和序;崔霞

作者机构：

关键词： 醋栗番茄;三代测序;基因组组装;结构变异

期刊名称：园艺学报

ISSN： 0513-353X

年卷期： 2022 年 10 期

页码：

收录情况： 北大核心（2020版） ; ; CSCD（2021-2022年度） ; ; 科技核心（2021版） ; ; 农林核心（2020版）

摘要： 利用HiFi长片段测序技术对醋栗番茄PI365967的基因组进行测序和从头组装,共构建了 924个连续的重叠群序列,N50长度高达12.8 Mb,获得了 PI365967染色体水平长度为834 M的高质量基因组序列.与栽培番茄Heinz1706基因组进行比较分析发现,二者存在倒位、缺失等大量结构变异.GO富集分析揭示了发生结构变异的基因可能的生物学功能.

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