柠檬色百合实时荧光定量PCR内参基因筛选
文献类型: 中文期刊
作者: 梁蕤;徐雷锋;毕蒙蒙;王静;唐玉超;郝泽慧;刘一洁;杨盼盼;明军;杜方
作者机构:
关键词: 柠檬色百合;实时荧光定量PCR;内参基因;类胡萝卜素
期刊名称:中国农业大学学报
ISSN: 1007-4333
年卷期: 2023 年 28 卷 2 期
页码:
收录情况: 北大核心(2020版) ; ; CSCD(2023-2024年度) ; ; 科技核心(2023版) ; ; 农林核心(2020版)
摘要: 为筛选柠檬色百合(Lilium leichtlinii)实时荧光定量PCR稳定的内参基因,以柠檬色百合不同发育时期花被片、根、茎、叶和鳞片为试验材料,测定比较总类胡萝卜素含量;使用RT-PCR和荧光定量PCR检测9个候选内参基因(AP4、Actin、β-TUB、CYP、eIF、GAPDH、RH2、UBC和18S)特异性及表达水平,利用geNorm、NormFinder、Bestkeeper、ΔCT程序和RefFinder网站综合评估候选内参基因表达稳定性;选用八氢番茄红素酶基因PSY对内参基因稳定性进行验证,最终确定合适且稳定的内参基因。结果表明:1)柠檬色百合花被片发育过程中Actin和AP4为9个候选内参基因中最稳定的内参基因,UBC为最不稳定的内参基因。2)柠檬色百合不同器官间eIF和AP4为候选内参基因中最稳定的内参基因,18S为最不稳定的内参基因。3)在柠檬色百合花被片发育过程和不同器官间,以筛选出最稳定的内参基因为参照计算所得PSY基因表达情况与实际测得总类胡萝卜素含量变化趋势一致;以筛选出最不稳定的内参基因作为参照计算所得PSY基因表达情况与总类胡萝卜素含量变化趋势不同甚至相反。研究表明在试验中不能随意使用内参基因,需要在使用前对其进行筛选、评价和验证,同时研究结果为柠檬色百合花被片发育过程和不同器官间基因表达分析提供了稳定的内参基因。
分类号:
- 相关文献
[1]热胁迫下糙皮侧耳实时荧光定量PCR内参基因的选择. 侯志浩,赵梦然,陈强,张妍,黄晨阳,邬向丽. 2019
[2]模拟增温下短花针茅实时荧光定量内参基因的筛选及验证. 高金玉,郭慧琴,曹路,韩冰. 2017
[3]毛白杨不同组织器官稳定表达看家基因的筛选. 王瑛,陈亚娟,丁莉萍,魏建华,王宏芝. 2016
[4]紫花苜蓿18SrRNA基因的克隆及内参基因表达稳定性评价. 付媛媛,穆春生,高洪文,李俊,王学敏. 2014
[5]鸡肌肉组织实时荧光定量PCR及Western杂交内参基因的筛选. 王红杨,刘冉冉,赵桂苹,郑麦青,李庆贺,李鹏,刘丽,文杰. 2015
[6]日粮精粗比对围产期奶牛乳腺内参基因表达的影响. 秦彤,王皓宇,郝海生,王栋,杜卫华,朱化彬. 2013
[7]紫云英实时荧光定量PCR分析中内参基因的选择. 张贤,王建红,李增强,曹凯,庄俐,徐昌旭,曹卫东. 2017
[8]苹果实时荧光定量PCR分析中内参基因的筛选. 周兰,张利义,张彩霞,康国栋,田义. 2012
[9]紫花苜蓿18S rRNA基因的克隆及内参基因表达稳定性评价. 付媛媛,穆春生,高洪文,李俊,王学敏. 2014
[10]鹿茸组织中内参基因的筛选. 张然然,刘华淼,邢秀梅,王磊. 2015
[11]偏穗鹅观草RT-PCR内参基因筛选及验证. 张宝蓉,解继红,金丹青,汪军成,姚立蓉,司二静,尚勋武,王化俊,李葆春. 2023
[12]葡萄实时荧光定量PCR稳定内参基因的筛选和验证. 任芳,张尊平,范旭东,胡国君,李晨,董雅凤. 2019
[13]磷胁迫下羊草的响应及磷响应相关基因表达分析. 万东莉,侯向阳,丁勇,任卫波,王凯,李西良,万永青. 2019
[14]牧草盲蝽实时定量PCR内参基因的筛选. 贾冰,马亿,庞保平,单艳敏,鲍青龙,韩海斌,谭瑶. 2019
[15]巴马小型猪组织qRT-PCR内参基因的筛选. 陈楚杰,裴杨莉,刘璐璐,杨亚岚,张垒霞,李华,李奎. 2020
[16]采用优化的数字PCR方法分析转基因小麦外源基因拷贝数. 琚鹏举,宁蕾,葛林豪,许成杰,史华伟,梁凯歌,马亮,刘陶然,陈明,孙黛珍. 2020
[17]刺萼龙葵种子中适宜内参基因的筛选. 赵丹丹,陈景超,黄兆峰,姜翠兰,黄红娟,张朝贤,李香菊,魏守辉. 2020
[18]玉米粗缩病诱导下实时荧光定量PCR内参基因的选择. 代资举,王艳,王新涛,杨青,张莹莹,李保全,王立平. 2019
[19]内参基因在昆虫实时荧光定量PCR中的研究进展. 史彩华,张友军. 2016
[20]两种内参基因在鸡循环miRNA相对定量检测中的比较分析. 朱云芬,韩威,苏一军,李国辉,王洪志,张会永,殷建玫. 2016
作者其他论文 更多>>
-
Development of Magnetic Lateral Flow and Direct Competitive Immunoassays for Sensitive and Specific Detection of Halosulfuron-Methyl Using a Novel Hapten and Monoclonal Antibod
作者:盈盈;;崔雪妍;;李辉;;潘凌屹;;罗婷;;曹振;;王静
关键词:
-
高光谱成像技术在农产品无损检测中的应用
作者:熊春晖;佘永新;焦逊;邵勇;贾莉;王淼;肖明;王静
关键词:高光谱成像技术;农产品;品质;无损检测
-
卷丹侧生器官边界域基因LlLBD18的克隆和功能分析
作者:殷小雨;何国仁;毕蒙蒙;唐玉超;郝春莲;渠雨潇;郝泽慧;徐雷锋;胡凤荣;杨盼盼;明军
关键词:卷丹;侧生器官;珠芽形成;基因克隆;功能分析
-
龙牙百合多糖的超声辅助提取及其抗氧化、降血脂活性分析
作者:王威振;杨盼盼;遆永瑞;唐玉超;徐雷锋;吴学尉;宋子涵;明军
关键词:龙牙百合;多糖;正交试验;抗氧化;胰脂肪酶
-
有机硅桶混助剂的毒理学及其分析方法研究进展
作者:李思蒙;李敏洁;王琦;邵华;郑鹭飞;王静;金芬
关键词:有机硅桶混助剂;聚氧乙烯醚改性三硅氧烷;非靶标生物;毒理学风险;分析方法
-
土壤中铬的毒性阈值(ECx)及其预测模型
作者:孙晓艺;王萌;秦璐瑶;俞磊;王静;陈世宝
关键词:铬;剂量-效应;低剂量毒物刺激效应;毒性阈值
-
一株耐酸性拮抗细菌的筛选、鉴定及对茄雷尔氏菌的抑制作用
作者:耿铭言;刘建阳;林伟;洪天龙;闫鼎;孔凡玉;王静;蔡宪杰
关键词:烟草青枯病;pH;次生代谢产物;脂肽类抗生素