甘蔗SoNIN1基因结构及其内含子信息分析
文献类型: 中文期刊
作者: 吴朝兴;杨丽涛;李杨瑞
作者机构:
关键词: 甘蔗;中性/碱性转化酶;外显子;内含子;信息分析
期刊名称:生物技术通报
ISSN: 1002-5464
年卷期: 2014 年 0 卷 12 期
页码: 147-152
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 根据前期克隆得到的So NIN1基因的全长c DNA和部分启动子序列设计引物,应用PCR技术从甘蔗叶片g DNA中克隆So NIN1基因,并利用生物信息学方法分析基因的结构。结果表明,So NIN1基因的DNA序列长4 938 bp,包含6个外显子和5个内含子,Gen Bank登录号KF563902。在该基因5'非翻译区存在一个268 bp内含子序列,同时5个内含子序列中含有与低温、干旱和激素等胁迫响应相关的作用元件,这些可能对So NIN1基因转录表达起调控作用。依据So NIN1蛋白聚类和外显子-内含子基因结构可以将植物NINs分为两类。
分类号: S566.1
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