数字农科院2.0

水稻全基因组选择信号检测方法比较及选择策略

文献类型： 中文期刊

作者： 王君瑞;郑晓明;崔永霞;李嘉琦;李飞;宋玥;格金月;乔卫华;程云连;张丽芳;姜明国;杨庆文

作者机构：

关键词： 水稻;基因组;选择信号;检测方法比较

期刊名称：分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2023 年

页码：

收录情况： 北大核心（2020版） ; ; 科技核心（2023版） ; ; 农林核心（2020版）

摘要： 作物经历驯化而来，驯化过程中会在基因组上留下特定的选择信号，对这些选择信号进行研究是挖掘重要功能基因的重要手段之一。当前已经涌现出了大量的统计方法用来检测基因组上的选择信号，因此，为了给研究者提供清晰的选择依据，本研究利用水稻基因组数据，根据选择信号的种类和检测方法，选取八种常用检测选择信号的统计方法对水稻全基因组的选择信号进行检测并进行比较分析，通过水稻主要驯化性状分析和比较不同统计方法的原理和生物学意义，为生物进化研究选择合理的统计分析方法和软件提供一定参考。

分类号：

  • 相关文献

[1]Chromosome-level genome of a multivoltine biotype Ostrinia furnacalis strain. Liu, Kaiqiang,Zhang, Tiantao,Zhang, Yongjun,Wang, Zhenying,He, Kanglai. 2025

[2]禾谷类物作的比较基因组研究. 郑康乐. 1996

[3]Association Mapping and Functional Analysis of Rice Cold Tolerance QTLs at the Bud Burst Stage. Dan Wang, Zhuo Liu, Yinghui Xiao, Xionglun Liu, Yue Chen, Zhuo Zhang, Houxiang Kang, Xuli Wang, Su Jiang, Shasha Peng, Xinqiu Tan, Deyong Zhang, Yong Liu, Guo-Liang Wang, Chenggang Li. 2021

[4]水稻重要农艺性状基因挖掘及育种利用. 余钧明,周蔚,邵高能,胡培松. 2025

[5]OsFT coordinates photosynthetic stability and carotenoid metabolism to regulate tillering in rice. 刘建国,,陈玉玉,,朱丽,,张光恒,,李清,,董国军,,郭龙彪,,高振宇,,胡江,,任德勇,,张强,,曾大力,,钱前,,沈兰. 2025

[6]全基因组选择信号检测方法在家畜研究中的应用进展. 阿地力江·卡德尔,刘雪雪,杨敏,玛哈巴·肉孜,蒋琳,马月辉. 2016

[7]不同尾型绵羊全基因组选择信号检测. 刘真,王慧华,刘瑞凿,吴明明,张淑珍,张莉,赵福平,杜立新,魏彩虹. 2015

[8]大白猪和通城猪全基因组选择性清扫分析. 李秀领,杨松柏,唐中林,李奎,刘榜,樊斌. 2012

[9]基于群体分化指数F_(ST)的绵羊全基因组选择信号检测. 曾滔,赵福平,王光凯,吴明明,魏彩虹,张莉,李利,张红平,杜立新. 2013

[10]基于温带和热带玉米群体全基因组FST和XP-EHH的选择信号检测. 杨宇昕,邹枨. 2019

[11]家养动物选择信号研究进展. 潘章源,贺小云,王翔宇,郭晓飞,曹晓涵,胡文萍,狄冉,刘秋月,储明星. 2016

[12]德保矮马X染色体选择信号筛选. 刘雪雪,阿地力江·卡德尔,董坤哲,王月月,潘建飞,浦亚斌,何晓红,马月辉,蒋琳. 2015

[13]苏尼特羊全基因组选择信号检测. 王光凯,曾滔,王慧华,张淑珍,张莉,魏彩虹,赵福平,杜立新. 2014

[14]基于温带和热带玉米群体全基因组 Fst和XP-EHH 的选择信号检测. 杨宇昕,,邹枨. 2019

[15]全基因组选择信号揭示绵羊毛囊发育及脱毛性状相关的候选基因. 雷志惠,张利平,赵洪昌,朱韶华,卢曾奎,郭婷婷,孙渭博,赫雪,岳耀敬. 2022

[16]全基因组选择信号解析野牦牛和天祝白牦牛的遗传差异. 鲍麒,梁春年,郭宪,李吉叶,褚敏,阎萍. 2022

[17]京星黄鸡IMF系全基因组选择信号检测分析. 王永丽,刘晓静,崔焕先,文杰. 2022

[18]里岔黑猪基因组选择信号检测与分析. 何晓锦,郭建华,刘洪江,伊宝,于光辉,王源. 2023

[19]中畜草原白羽肉鸭与樱桃谷鸭的遗传差异分析. 于思梦,郭占宝,胡健,周正奎,侯水生. 2022

[20]基因组选择信号揭示西×荷杂交牛杂种优势相关基因. 范婷婷,马毅,王兢,赵国耀,徐凌洋,陈燕,张路培,高会江,李俊雅,高雪. 2023

作者其他论文 更多>>