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广西南宁猪繁殖与呼吸综合征病毒流行毒株ORF5和NSP2基因的遗传变异分析

文献类型： 中文期刊

作者： 李瑞雪;李承辉;陈俭;李健;南世发;王瑛春;卢德章;肖书奇;殷玉鹏

作者机构：

关键词： 猪繁殖与呼吸障碍综合征;ORF5;NSP2;遗传进化分析

期刊名称：病毒学报

ISSN： 1000-8721

年卷期： 2024 年

页码：

收录情况： 北大核心（2023版） ; ; CSCD（2023-2024年度） ; ; 科技核心（2024版）

摘要： 本文旨在监测广西南宁猪场猪繁殖与呼吸综合征病病毒（Porcine reproductive and respiratory syndrome virus,PRRSV）的流行情况。采集2022年广西壮族自治区南宁市4个不同规模化猪场的9322份血清样品、1348份睾丸液、402份精液样品、3083份唾液样品和787份环境样品，使用qRT-PCR方法对样品中的病原进行检测，同时扩增PRRSV阳性样品的ORF5和NSP2基因；测序后利用DNAStar软件进行遗传进化分析、氨基酸序列比对分析，并对ORF5基因的N-糖基化位点进行预测。从PRRSV阳性样品中成功获得23条ORF5基因序列和18条NSP2基因序列，基于ORF5基因遗传进化分析属于PRRSV美洲型，其中NADC30-like毒株13株，NADC34-like毒株9株，VR2332-Like毒株1株。对ORF5氨基酸进行多序列比对显示，23株毒株无插入或缺失，但都存在位点突变。基于NSP2基因遗传进化分析显示为PRRSV美洲型，对NSP2氨基酸进行多序列比对显示，18株PRRSV存在1+19个氨基酸的缺失，与NADC30毒株NSP2氨基酸对应位置缺失模式一致。结果表明，该地区猪场主要流行NADC30-Like和NADC34-Like毒株，PRRSV不同流行毒株存在一定的遗传差异，本研究为广西PRRS防控和疫苗选用提供了科学依据。

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