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绵羊C3d基因克隆及分子特征

文献类型： 中文期刊

作者： 岳耀敬;焦硕;郭宪;冯瑞林

作者机构：

关键词： 绵羊;补体C3d基因;分子特征;结构预测

期刊名称：农业生物技术学报

ISSN： 1006-1304

年卷期： 2008 年 16 卷 04 期

页码： 31-37

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 从绵羊(Ovis aries)肝脏组织克隆到了补体C3d基因并对其核苷酸序列和推导的氨基酸序列以及蛋白结构进行了分析。绵羊补体C3d基因的编码区含有909个核苷酸,编码303个氨基酸残基(GenBank No.EF681138)。绵羊C3d与人(Homo sapiens)、牛(Bos taurus)、山羊(Capra hircus)、野猪(Sus scrofa)、金仓鼠(Mesocricetus auratus)、小鼠(Mus musculus)、褐鼠(Rat- tus norvegicus)、大袋鼠(Macropus eugenii)、兔(Oryctolagus cuniculus)和原鸡(Gallus gallus)推导出的C3d氨基酸序列的一致性分别为80.4%,94.7%,96.9%,82.8%,81.1%,80.6%,80.2%,71.0%,75.2%和60.3%。绵羊与原鸡C3d的一致性最低为60.3%,而与其它动物C3d之间的一致性则较高为71.0%～96.9%。生物学软件分析发现,绵羊C3d蛋白有2个蛋白激酶C磷酸化位点,1个氨基葡聚糖附着位点,1个酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化位点,1个酪氨酸激酶磷酸化位点,1个十四(烷)酰化位点。绵羊C3d二级结构中螺旋和转角交替出现,其中α螺旋占55.12%,β折叠为2.31%,转角区域为42.57%,这样的结构有利于其桶状结构的形成。ESyPred3D同源建模预测可知绵羊C3d三级结构与人C3d一样也形成由核心和外层构成的桶状分子结构。

分类号： S826

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