烟草生长素受体基因家族鉴定及表达分析
文献类型: 中文期刊
作者: 高军平;杨小年;谢小东;朱丽颖;李冰洁;李锋;黄平俊;何鑫玺;李泽锋;王帅斌;陈凯;罗朝鹏;吕婧;孙玉合;杨军
作者机构:
关键词: 烟草;生长素受体;二氯喹啉酸药害;基因家族
期刊名称:烟草科技
ISSN: 1002-0861
年卷期: 2025 年
页码:
收录情况: 北大核心(2023版) ; ; CSCD(2025-2026年度) ; ; 科技核心(2024版) ; ; 农林核心(2024版)
摘要: 为明确烟草TIR1/AFBs家族基因对生长素类除草剂的抗性,阐明二氯喹啉酸药害的机理,对烟草生长素受体基因家族进行鉴定,并对基因表达模式进行分析。结果表明,普通烟草存在10个NtTIR1/AFBs基因。亚细胞定位分析显示,有5个NtTIR1/AFBs定位在细胞核,3个定位在细胞质,2个定位在叶绿体。进化分析表明,NtTIR1/AFBs进化分为4类,拟南芥的AtTIR1/AFBs分为3类。蛋白结构域分析显示,NtTIR1/AFBs主要含有F-box和LRR保守结构域。在结构域的数量上,NtTIR1/AFBs和AtTIR1/AFBs存在差异。MicroRNA靶点分析发现,4个NtTIR1/AFBs含有潜在的miRNA靶点,其中20083和20090基因均含有8个miRNA靶点。组织表达分析表明,20081、20082、20088和20091 4个基因在烟草各组织中的表达量相对较高。二氯喹啉酸处理后基因表达分析显示,20085和20086基因在烟草根系中上调表达幅度较大,20082基因在烟草叶片中上调幅度最大,而20081和20090基因在烟草叶片中下调幅度较大。
分类号:
- 相关文献
[1]烟草C2H2锌指蛋白转录因子家族成员的鉴定与表达分析. 杨明磊,晁江涛,王大伟,胡军华,吴华,龚达平,刘贯山. 2016
[2]兰花磷酸肌醇特异性磷脂酶C基因家族生物信息学分析. 胡广隆,陈亚娟,魏建华,王宏芝,张杰伟. 2017
[3]毛果杨CBF/DREB1基因家族生物信息学分析. 丁咚,陈亚娟,崔进荣,魏建华,张玉红,张杰伟. 2018
[4]棉花中HD-Zip Ⅳ家族基因的全基因组鉴定及特征分析. 王瑞,鲁丽丽,刘拓,章志强,马宗斌,李伶俐,刘伟,杨作仁,朱伟. 2017
[5]拟南芥和水稻CPP转录因子家族的生物信息学分析. 王凯. 2010
[6]桃磷酸肌醇特异性磷脂酶C基因家族鉴定与分析. 张杰伟,任飞,张中保,谢华,魏建华. 2017
[7]兰花eIF5A基因家族鉴定与生物信息学分析. 张杰伟,汤久杨,陈兰芬,王宁琳,王宏芝,魏建华. 2017
[8]猪带绦虫45W基因家族的克隆及A_3与B_2的表达和结构预测. 郑亚东,贾万忠,骆学农,景志忠,才学鹏. 2004
[9]硬粒小麦Glu-B3基因家族新成员的克隆及其分子标记的开发. 赵永涛,孔秀英,詹克慧. 2008
[10]猪带绦虫六钩蚴45W基因家族分子克隆. 才学鹏,郑亚东,贾万忠,骆学农,景志忠,陆承平. 2005
[11]花生白藜芦醇合成酶基因家族序列克隆及分析. 周元青,杨艳燕,黄家权,廖伯寿. 2008
[12]杨树磷酸肌醇特异性磷脂酶C基因家族鉴定与分析. 张杰伟,丁莉萍,陈亚娟,王宏芝,魏建华. 2016
[13]桃钙调磷酸酶B类似蛋白基因家族鉴定与分析. 张杰伟,吴婷,任飞,谢华,魏建华. 2017
[14]水稻中富含亮氨酸的重复序列和核苷酸结合位点(LRR-NBS)基因家族的生物信息学分析. 孙学辉,路铁刚,贾士荣,黄大昉. 2004
[15]猪白介素家族重要基因的克隆、表达及其结构与功能预测分析. 景志忠,窦永喜,罗启慧,陈国华,蒙学莲,郑亚东,骆学农,才学鹏. 2006
[16]桃WRKY基因家族全基因组鉴定和表达分析. 谷彦冰,冀志蕊,迟福梅,乔壮,徐成楠,张俊祥,周宗山,董庆龙. 2016
[17]苹果WRKY基因家族生物信息学及表达分析. 谷彦冰,冀志蕊,迟福梅,乔壮,徐成楠,张俊祥,董庆龙,周宗山. 2015
[18]夏橙果实离层中伤害诱导基因的克隆与表达分析. 杨雪莲,张凌云,王志卫,黄勇,闫树堂,钟广炎. 2010
[19]大麦蛋白质二硫键异构酶基因家族的鉴定与表达分析. 时丽洁,蒋枞璁,王方梅,杨平,冯宗云. 2019
[20]油菜超氧化物歧化酶基因家族生物信息学分析. 郭栋,张艳阳,杜媚,周宝元,高卓晗,赵明,袁卉馥. 2020
作者其他论文 更多>>
-
Application of dihydroquercetin reduces oxidative damage and enhances drought resistance in wheat
作者:王琦玉;郭佳庆;许成杰;唐文思;陈凯;王玉龙;周永斌;陈隽;徐兆师;王曙光;马有志;陈明;孙黛珍
关键词:Wheat;Drought stress;Dihydroquercetin;Transcriptome analysis;Antioxidant;Membrane
-
Identification of advantaged genes for low-nitrogen-tolerance-related traits in rice using a genome-wide association study
作者:张志远;;翟来圆;;刘毓卓;;田林;;朱双兵;;申聪聪;;贾举庆;;陈凯;;徐建龙
关键词:candidate gene; genome-wide association study (GWAS); haplotype analysis; lower nitrogen; rice
-
稻油轮作秸秆还田下土壤铁氧化物对团聚体稳定性的影响
作者:廖楚芊;刘淑军;李冰洁;黄晶;段英华;韩建刚;朱永莉
关键词:秸秆还田;土壤团聚体;铁氧化物;络合铁;晶型铁氧化物
-
全基因组关联分析结合单倍型分析挖掘水稻耐低氮候选基因
作者:邵美红;赵玲玲;程楚;程思明;朱双兵;翟来圆;陈凯;徐建龙
关键词:(0-1-2)耐低氮;全基因组关联分析;单倍型分析;候选基因
-
不同营养水平饲粮对猫肠道菌群的影响
作者:刘恋;陶贻炯;李昭龙;陈凯;赵念;许久;郭利伟;王米
关键词:猫粮;营养水平;生长性能;肠道菌群
-
烟草脂类合成关键基因NtLPAT的功能验证
作者:吉白璐;孙艺文;刘万峰;钱亚新;蒋彩虹;耿锐梅;刘旦;程立锐;杨爱国;黄立钰;李晓旭;蒲文宣;高军平;张强;文柳璎
关键词:溶血磷脂酰基转移酶;烟草;基因敲除;脂质组学;转录组学
-
长期秸秆还田水稻土团聚体内铁结合态有机碳的分布特征及其性质
作者:李冰洁;高菊生;段英华;黄晶
关键词:水稻土;有机碳;团聚体;铁结合态有机碳;芳香性
