牦牛TBC1D7基因克隆、生物信息学及表达分析
文献类型: 中文期刊
作者: 张娟香;欧杰次仁;喇永富;马晓明;吴晓云;郭宪;褚敏;阎萍;梁春年
作者机构:
关键词: 西藏牦牛;TBC1D7基因;克隆;生物学分析;组织表达
期刊名称:中国草食动物科学
ISSN: 2095-3887
年卷期: 2024 年 44 卷 02 期
页码:
收录情况: 北大核心(2023版) ; ; 农林核心(2020版)
摘要: 为探究西藏牦牛Tre2-Bub2-CDC16结构域家族成员7(TBC1D7)基因的特征及结构,利用RT-PCR克隆了TBC1D7基因的CDS区序列,并对其进行了生物信息学分析,利用实时荧光定量PCR(qPCR)检测了TBC1D7基因在牦牛心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏、肌肉及脂肪组织的表达水平。结果表明,牦牛TBC1D7基因的CDS区全长为882 bp,共编码293个氨基酸;系统进化树分析结果表明,西藏牦牛与野牦牛的亲缘关系最近,与兔的最远;生物信息学分析结果表明,牦牛TBC1D7蛋白不存在信号肽和跨膜结构,属于亲水性蛋白,主要存在细胞核中,且该蛋白具有24个潜在的磷酸化位点,蛋白的高级结构由α-螺旋(65.53%)、延伸连(3.75%)、β-转角(3.75%)和无规则卷曲(29.96%)构成。qPCR检测结果显示,TBC1D7基因在西藏牦牛脾脏组织中的表达最高,极显著高于其他组织(P <0.01)。
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