鼠伤寒沙门菌新型转录因子STM0859的基因克隆、分子特征及其遗传进化分析
文献类型: 中文期刊
作者: 马忠梅;宁程程;郭蕴;季春晖;孟庆玲;乔军;张星星;才学鹏
作者机构:
关键词: 鼠伤寒沙门菌;STM0859基因;克隆;分子特征;遗传进化分析
期刊名称:西南农业学报
ISSN: 1001-4829
年卷期: 2021 年 34.0 卷 4.0 期
页码:
收录情况: 北大核心(2020版) ; CSCD(2020-2021年度) ; 农林核心(2020版) ; 科技核心(2020版)
摘要: 【目的】为鼠伤寒沙门菌STM0859基因的进一步研究提供理论参考。【方法】采用PCR方法扩增鼠伤寒沙门菌SL1344强毒株新型转录因子STM0859基因,并进行克隆和测序,预测分析其编码蛋白的分子特征,并将其与ST不同菌株及其他种属细菌同源基因进行遗传进化分析。【结果】ST SL1344 STM0859基因全长891 bp,编码296个氨基酸;二级结构预测发现,该蛋白含有1个DNA底物结合域(90aa-293aa)和1个由螺旋-转角-螺旋构成的HTH-18结构域(5aa~64aa),无信号肽序列及跨膜结构。序列比较发现,STM0859基因属于LysR家族转录调节蛋白,与大肠杆菌和不动杆菌LysR家族转录调控因子相似,其N端含有1个H-T-H超二级结构域,C端具有1个PBP2配体结合域。遗传进化分析显示,ST SL1344株STM0859基因与ST 14028S亲缘性最高,而与肠道沙门氏菌肠道亚种R8-34041株、鸡肠炎血清型str.287/911株、大肠杆菌str.K-12亚群MG 1655株亲缘关系较远,提示STM0859基因在ST菌株间具有较高的保守性。【结论】STM0859基因为新型LysR家族转录因子,可作为构建ST基因缺失株疫苗的候选基因。
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