少孢节丛孢菌XJ-A1几丁质酶基因的克隆及生物信息学分析
文献类型: 中文期刊
作者: 赵海龙;孟庆玲;乔军;贡莎莎;胡政香;刘田莉;才学鹏;陈创夫
作者机构:
关键词: 少孢节丛孢菌;几丁质酶;基因克隆;生物信息学
期刊名称:西北农业学报
ISSN: 1004-1389
年卷期: 2015 年 24 卷 03 期
页码: 26-32
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 为研究捕食线虫性真菌几丁质酶的功能,在国内首次对少孢节丛孢菌XJ-A1几丁质酶AO-801和AO-483基因进行扩增、克隆及测序,并对其编码蛋白信号肽、疏水性与亲水性、高级结构、功能域进行预测和分析。结果显示,2个不同蛋白均具有典型的几丁质酶催化区保守序列SXGGW和DGXDXDWE,属于糖苷水解酶18家族几丁质酶,无信号肽序列,表明这2个蛋白为非分泌型蛋白,二级结构以无规则卷曲、α-螺旋和β-折叠为蛋白的主要结构元件,三级结构中有(α/β)8的圆桶形结构。系统发育分析表明,几丁质酶AO-801和AO-483与昆虫病原真菌几丁质酶的亲缘关系更为接近,说明它们所产生的几丁质酶在侵染宿主的过程中发挥着类似的功能,并且不同来源真菌几丁质酶根据分子质量的差异形成3个不同的进化分枝。
分类号: Q78
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