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基于EF-1α和β微管蛋白基因序列的棉花枯萎病菌遗传多样性和单倍型分析

文献类型： 中文期刊

作者： 王海莹;陈小海;钟烨仪;龚举武;刘平;Chin Yaoxian;王沛政;袁有禄

作者机构：

关键词： 棉花;枯萎病菌;单倍型分析;遗传多样性分析;延伸因子1α;β微管蛋白

期刊名称：棉花学报

ISSN： 1002-7807

年卷期： 2023 年 4 期

页码：

收录情况： 北大核心（2020版） ; ; CSCD（2023-2024年度） ; ; 科技核心（2023版） ; ; 农林核心（2020版）

摘要： [目的]通过分析棉花枯萎病菌的遗传多样性,探究新疆棉花枯萎病菌株的分群及其演化.[方法]2022年在新疆不同植棉区共分离出 22 株棉花枯萎病菌株,对延伸因子 1α(elongation factor-1α,EF-1α)和β微管蛋白基因进行扩增、测序,并从美国国立生物技术信息中心(National Center for Biotechnology Information,NCBI)数据库获取 36 个棉花枯萎病菌株的相关基因序列信息.基于上述基因序列分别进行系统进化分析和单倍型分析.[结果]基于 57 条EF-1α基因序列的进化树分析表明,棉花枯萎病菌可分为 3 大群,第 1 大群包含来自新疆、河北和澳大利亚的共 31 个枯萎病菌株,该大群可分成 4 个亚群;第 2 大群包含 25 个枯萎病菌株,构成比较复杂,可分成 3 个亚群;第 3 大群仅包含美国菌株LA140.基于 28 条β微管蛋白基因序列的进化树分析表明,本次分离的新疆棉花枯萎病菌株与棉花枯萎病菌 7 号和 8 号生理小种不同.根据EF-1α基因序列构建的单倍型网络将棉花枯萎病菌株分为 19 个单倍型,新疆 21 个棉花枯萎病菌株归属于有共同起源的 5 种单倍型.[结论]本研究分离的新疆棉花枯萎病菌株与已报道的棉花枯萎病菌 1～8 号生理小种均不相同,但与河北菌株的亲缘关系较近.EF-1α单倍型分析表明,本研究中的所有棉花枯萎病菌均从 1 号生理小种演化而来.

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