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马铃薯腐烂茎线虫L型半胱氨酸蛋白酶新基因(Dd-cpl-1)的克隆与序列分析

文献类型： 中文期刊

作者： 彭德良;孙建华;黄文坤;彭焕;龙海波

作者机构：

关键词： 马铃薯腐烂茎线虫;L型半胱氨酸蛋白酶;Dd-cpl-1

期刊名称：生物工程学报

ISSN： 1000-3061

年卷期： 2011 年 27 卷 01 期

页码： 67-75

收录情况： 北大核心

摘要： L型半胱氨酸蛋白酶基因(Cathepsin L-like cysteine proteinase gene)为与植物寄生线虫寄生能力相关的多功能基因。运用RT-PCR和RACE的方法从马铃薯腐烂茎线虫Ditylenchus destructor中克隆出1个L型半胱氨酸蛋白酶新基因Dd-cpl-1(GenBank登录号为GQ180107)。该基因Dd-cpl-1 cDNA全长序列含有1个1 131 bp的开放性阅读框(ORF),编码376个氨基酸残基,其5′末端及3′末端分别含有29 bp和159 bp的非编码区(UTR)。Dd-cpl-1内含子外显子结构分析结果表明,其基因组序列包含7个内含子,且各内含子两端剪接位点序列遵守GT/AG规则。Dd-cpl-1基因推定的蛋白Dd-CPL-1与松材线虫L型半胱氨酸蛋白酶高度同源,一致性达到77%。以不同物种中L型半胱氨酸蛋白酶氨基酸序列进行比对分析,推测推定的蛋白Dd-CPL-1含有L型半胱氨酸蛋白酶基因家族高度保守的催化三联体(Cys183,His322和Asn343)以及ERFNIN基系和GNFD基系。半胱氨酸蛋白酶系统发育分析表明,Dd-cpl-1属于由L型半胱氨酸蛋白酶组成的进化分支。Dd-cpl-1的这些序列特征进一步表明其为L型半胱氨酸蛋白酶基因。这是首次在马铃薯腐烂茎线虫中克隆到的L型半胱氨酸蛋白酶,为今后在蛋白水平对其进行进一步的功能分析提供基础。

分类号： S435.31

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