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大型奶牛养殖环境源大肠埃希菌毒力基因与系统进化分群

文献类型： 中文期刊

作者： 唐敏嘉;张雪婧;何卓琳;蒲万霞

作者机构：

关键词： 大肠埃希菌;奶牛养殖环境;毒力基因;系统进化分群

期刊名称：中国兽医学报

ISSN： 1005-4545

年卷期： 2022 年

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收录情况： 北大核心（2020版） ; CSCD（2021-2022年度） ; 科技核心（2021版） ; 农林核心（2020版）

摘要： 对甘肃两个大型奶牛养殖环境的大肠埃希菌（Escherichiacoli,Ec.oli）分离株进行系统进化分群和毒力基因分布情况研究,分析系统群与Ec.oli主要毒力基因之间的潜在关联,以期为Ec.oli的研究和防治提供参考.利用PCR方法对281株Ec.oli分离株进行系统进化分群鉴定和毒力基因检测.281株Ec.oli分离株被分为8个系统进化群,B1、A、E、F、D、C、B2群和隐支Ⅰ或Ⅱ的占比分别为51.96%,28.47%,11.39%,2.85%,1.78%,1.07%,0.71%和0.36%,有4株为未知系统群.毒力基因检测结果显示,ompA、ibeB、ompT、iroN、traT、iucD、fyuA和irp2的阳性率分别为100%,98.58%,76.16%,71.53%,68.33%,64.06%,30.96%和30.25%.不同年份和养殖环境的部分毒力基因的分布存在明显差异,携带8个所鉴定的毒力基因的菌株在B1、B2群和粪土源中的分布较多;tra T在2017年的分布明显低于2018和2019年;tra T和iro N在粪土源分离株中的分布高于污水源.系统群与毒力基因的关联性分析结果 显示,A群与ompT和traT存在负相关性;B1群与ompT、irp2、fyuA和iucD存在正相关性;E群与irp2、fyuA和iucD存在负相关性,与iroN存在正相关性.系统进化分群以B1群为主;不同年份和养殖环境的部分毒力基因的分布有明显的差异;部分毒力基因的分布与系统群存在联系.

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