文献类型： 中文期刊
作者： 杨清清;贾万忠;王向前;蔡其刚;葛新;汪伟;韩秀敏
作者机构：
关键词： 泡型棘球蚴病;单细胞转录组测序;组织微环境;转录谱特征
期刊名称：中国血吸虫病防治杂志
ISSN： 1005-6661
年卷期： 2023 年
页码：
收录情况： 北大核心（2020版） ; ; CSCD（2023-2024年度） ; ; 科技核心（2023版）
摘要： 目的 从单细胞水平探究多房棘球蚴感染小鼠晚期阶段肝脏组织微环境细胞组成及其转录谱特征。方法 收集2只多房棘球蚴感染BALB/c小鼠肝脏病灶旁组织和配对远端肝组织进行单细胞转录组测序。利用R软件Seurat包对获得的数据进行质量控制、多样本整合和批次效应校正，应用统一流形逼近与投影（uniform manifold approximation and projection,UMAP）算法进行细胞聚类，根据经典标记基因注释细胞类型。通过差异基因表达分析筛选各细胞类型的差异表达基因，进行基因本体论（Gene Ontology,GO）和京都基因与基因组百科全书（Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG）功能富集分析预测细胞生物学作用。结果 对来自多房棘球蚴感染小鼠肝脏病灶旁和远端肝组织的43 710个细胞进行了分析，归类为11种细胞类型：中性粒细胞、T细胞、巨噬细胞、粒细胞-单核细胞祖细胞、B细胞、浆细胞、嗜碱性粒细胞、肝星状细胞、内皮细胞、肝细胞、血小板。T细胞是组织微环境中占比最高的免疫细胞，包括5种CD4+T细胞、2种CD8+T细胞和磷酸抗原反应γδ T细胞。与病灶远端肝组织相比，病灶旁肝组织中的CD4+辅助性T细胞和CD4+细胞毒性T细胞比例降低、辅助型T细胞2（Th2细胞）比例明显增高。Th2细胞差异表达基因主要与免疫系统负调控过程相关，CD4+细胞毒性T细胞高表达基因与免疫系统激活相关。结论 通过单细胞转录组测序揭示了多房棘球蚴感染小鼠肝组织微环境中的细胞组成和分布差异，病灶旁肝组织中Th2细胞升高可能与免疫抑制性微环境形成有关。
分类号：
- 相关文献
[1]基于单细胞转录组测序技术的泡型棘球蚴病患者肝脏T细胞分类及功能解析. 陈思,王向前,贾万忠,蔡其刚,张学勇,张强,郑海波,朱凌虹,李冰,汪伟,韩秀敏. 2024
[2]青海省儿童青少年泡型棘球蚴病住院患者流行病学和临床特征分析. 安虎妞,朱文君,张学勇,王向前,陈思,上官朝亮,朱海宏,郑海波,张连香,贾万忠,段李平,韩秀敏. 2024
[3]天祝白牦牛退行期毛囊细胞亚群鉴定以及特征基因生物信息学分析. 郑青波,叶娜,张哓兰,包鹏甲,王福彬,任稳稳,廖月姣,阎萍,潘和平. 2022
[4]单细胞转录组测序在植物组织发育研究中的应用. 苗龙,汪文辉,何艮华,李佳佳,高慧慧,王晓波,邱丽娟. 2023
[5]单细胞测序技术及其在毛囊发育中的应用. 叶娜,张晓兰,包鹏甲,王兴东,阎萍,潘和平. 2021
[6]基于单细胞转录组测序的鹿茸生长中心细胞异质性研究. 丁宁,张然然,范广轩,邢秀梅,刘欣. 2024
作者其他论文 更多>>
-
多头带绦虫具有黏附活性新蛋白的功能鉴定
作者：李文卉;岳龙;曲自刚;张念章;李立;闫鸿斌;贾万忠;殷宏;付宝权;次旦欧珠;米平
关键词：多头带绦虫;纤连蛋白三型(FNⅢ)结构域;黏附活性;组织定位;免疫保护
-
孤儿核受体NR4A1在肝疾病中的作用与研究进展
作者：詹舒懿;吴耀东;张雯丽;张念章;逯文颖;贾万忠;李立;闫鸿斌
关键词：核受体亚家族4A成员1;代谢相关性脂肪性肝病;肝纤维化;肝细胞癌;肝病;作用机制
-
多房棘球蚴感染小鼠肝转录组分析及肝纤维化关键基因的筛选与验证
作者：孙慧;李立;闫鸿斌;李秀荣;吴耀东;何兴;殷宏;付宝权;贾万忠
关键词：多房棘球蚴;转录组测序;生物信息学;纤维化;神经生长因子
-
多房棘球绦虫感染的检测方法研究进展
作者：游杰;李立;孙继文;詹舒懿;逯文颖;周蜓蜓;殷宏;贾万忠;闫鸿斌
关键词：多房棘球绦虫;犬科动物;粪DNA;粪抗原;分子生物学诊断;免疫诊断
-
单细胞转录组学技术及其在寄生虫研究中的应用进展
作者：周蜓蜓;李立;吴燕涛;逯文颖;付宝权;殷宏;贾万忠;闫鸿斌
关键词：单细胞测序;数据分析;寄生虫病
-
青海省儿童青少年泡型棘球蚴病住院患者流行病学和临床特征分析
作者：安虎妞;朱文君;张学勇;王向前;陈思;上官朝亮;朱海宏;郑海波;张连香;贾万忠;段李平;韩秀敏
关键词：青海省;儿童青少年;泡型棘球蚴病;住院患者;流行病学;临床特征
-
基于单细胞转录组测序技术的泡型棘球蚴病患者肝脏T细胞分类及功能解析
作者：陈思;王向前;贾万忠;蔡其刚;张学勇;张强;郑海波;朱凌虹;李冰;汪伟;韩秀敏
关键词：泡型棘球蚴病;单细胞转录组测序;细胞图谱;肝脏;免疫微环境;T细胞亚型