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利用基因组文库加速Xa23基因定位的染色体步移

文献类型： 中文期刊

作者： 王春连;陈乐天;曾超珍;张群宇;刘丕庆;刘耀光;樊颖伦;章琦;赵开军

作者机构：

关键词： 水稻白叶枯病;抗性基因;基因定位;TAC文库;PAC文库;染色体步移

期刊名称：中国水稻科学

ISSN： 1001-7216

年卷期： 2006 年 20 卷 04 期

页码： 355-360

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 用距离水稻抗白叶枯病基因Xa230.8 cM的EST标记C189,扩增Xa23的近等基因系CBB23的基因组片段(0.8 kb)为探针,筛选水稻明恢63的TAC文库和广陆矮4号的PAC文库,对获得的7个阳性克隆用酶切法和Tail-PCR法进行末端片段分离,获得15个末端片段,用于感病亲本金刚30和抗病亲本CBB23之间的多态性检测,发现7个末端片段在双亲间有多态性,分别为69B、70N、81N、45B、45N、84N和84B。用这些末端片段作RFLP标记,对金刚30/CBB23的F2群体进行检测和连锁分析,结果表明这些标记与Xa23的遗传距离依次为0.4、0.4、0.4、0.5、0.6、0.6和1.1 cM。虽然69B、70N和81N与Xa23的遗传距离均为0.4 cM,但序列比对揭示69B与70N的物理距离为35 kb,与81N为95 kb,69B距Xa23最近。三者与Xa23的遗传距离虽然相同,但物理距离存在很大差异。这些末端片段标记加密了Xa23基因一侧的遗传图谱,并使其遗传距离缩短到0.4 cM,加速了Xa23的定位进程,为Xa23的分离克隆奠定了重要基础。讨论了这种染色体步移方法的适用条件。

分类号： S511

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