数字农科院2.0

大通牦牛PDGFD基因克隆、生物信息学及组织表达谱分析

文献类型： 中文期刊

作者： 李歆怡;王福彬;黄纯;马晓明;喇永福;褚敏;郭宪;阎萍;潘和平;梁春年

作者机构：

关键词： 大通牦牛;血小板源性生长因子D（PDGFD）基因;蛋白功能分析;脂肪组织;基因表达

期刊名称：农业生物技术学报

ISSN： 1674-7968

年卷期： 2023 年 31 卷 03 期

页码：

收录情况： 北大核心（2020版） ; ; CSCD（2023-2024年度） ; ; 科技核心（2023版） ; ; 农林核心（2020版）

摘要： 牦牛（Bos mutus）是高原地区十分重要的种质资源。为研究牦牛血小板源性生长因子D （plateletderived growth factor D, PDGFD）基因的结构及功能，并探究其在牦牛不同年龄的7个组织中的表达情况，本研究以36月龄大通牦牛的皮下脂肪组织cDNA为模板克隆牦牛PDGFD基因的CDS序列，利用基因序列进行生物信息学分析及蛋白理化性质预测，q PCR检测PDGFD在大通牦牛胚胎期150 d与36月龄成年时期2个年龄段7个组织（心,肝,脾,肺,肾,背最长肌,皮下脂肪）中的相对表达量。结果表明，大通牦牛PDGFD的CDS区全长为1 095 bp，共编码氨基酸364个，同野牦牛PDGFD基因的亲缘关系最近（99.8%），与猪（Sus scrofa）最远（91.2%）；牦牛PDGFD蛋白预测为稳定的亲水性分泌蛋白，无跨膜结构域，存在1个CUB结构域（116 aa）及1个PDGF结构域（93 aa）;PDGFD蛋白高级结构由无规则卷曲（48.21%）、α-螺旋（25.62%）、延伸链（21.49%）和β-转角（4.68%）相互连接而成，主要与同为血小板源性生长因子、血管内皮生长因子相关蛋白相互作用。qPCR结果显示，牦牛2个发育阶段的7个组织中均有PDGFD基因的表达，在对比2个时期的PDGFD基因组织表达规律后发现，心脏中的基因表达维持在较高水平，脂肪组织中的基因表达量变化最大，随着牦牛生长极显著升高（P＜0.001）。推测PDGFD基因与牦牛心脏发育有着密切关系，在生长发育过程中影响脂肪的沉积。本研究为PFGFD基因在牦牛脂肪沉积的调控机制的研究提供理论依据，可以作为牦牛的遗传育种的参考。

分类号：

  • 相关文献

[1]呼伦贝尔羊重要脂肪相关基因mRNA差异表达分析. 邓天宇,樊红樱,杜立新,赵福平,王立贤. 2019

[2]绵羊前体脂肪细胞的分离培养及诱导分化. 崔京京,富俊才,孙岩,陈东. 2012

[3]高效液相色谱-串联质谱法测定鸡脂肪中地克珠利残留量. 罗浩师,张丽芳,薛飞群. 2012

[4]北京油鸡与AA肉鸡脂肪组织差异表达基因的研究. 苗向阳,冯浩咏. 2010

[5]持续高温对育肥猪不同部位脂肪代谢的影响. 吴鑫,冯京海,张敏红,苏红光,贾安峰. 2015

[6]UCP3基因在巴马猪和藏猪脂肪组织中的表达和甲基化分析. 范一萍,王彦芳,陶聪. 2019

[7]大通牦牛犊牛早期培育效果观察. 赵寿保,马进寿,李青云,刘更寿,保广才,武甫德,郭宪,马海福,胡燕斌,马国军,乔元贵,李索南. 2019

[8]大通牦牛的培育. 柏家林,陆仲璘,王敏强,阎萍,杨博辉. 2005

[9]充分利用野牦牛遗传资源培育牦牛新品种——青海高原牦牛新品种《大通牦牛》育种配套技术. 陆仲璘. 2005

[10]大通牦牛提纯复壮当地牦牛效果的研究. 王宏博,郎侠,梁春年,丁学智,郭宪,包鹏甲,阎萍. 2012

[11]青海大通牦牛肌间脂肪酸组成分析. 张永辉,阎萍,王强,梁春年,曾玉峰. 2009

[12]牦牛生长激素基因及其受体基因的PCR-SSCP研究. 阎萍,张森,梁春年,包鹏甲,曾玉峰,郭宪,裴杰,褚敏. 2010

[13]大通牦牛肌肉纤维组织学特性研究. 杨博辉,王敏强,陆仲璘,柏家林,阎萍. 2005

[14]大通牦牛IGF-I基因多态性及其与生长性能相关性的研究. 潘和平,姚玉妮,梁春年,裴杰,曾玉峰,阎萍. 2008

[15]“大通牦牛”新品种及培育技术. 阎萍,陆仲,何晓林,杨博辉. 2006

[16]大通牦牛产毛性能的研究. 杨博辉,陆仲璘,王敏强,柏家林,阎萍. 2005

[17]大通牦牛改良当地牦牛生产性能效果的研究. 王宏博,阎萍. 2012

[18]牦牛METTL14 CDS区克隆及表达谱分析. 马兰花,顾亚荣,张永峰,潘和平,阎萍. 2021

[19]肉牛遗传资源培育品种价值评估体系构建——以大通牦牛为例. 马卓,马芝祥,浦华. 2024

[20]响应黄龙病侵染的柑橘乙醇脱氢酶基因CsADH1的克隆与表达分析. 谢竹,赵珂,郑林,龙俊宏,杜美霞,何永睿,陈善春,邹修平. 2020

作者其他论文 更多>>