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一种大豆SNP分型新方法

文献类型： 中文期刊

作者： 袁翠平;李英慧;刘章雄;关荣霞;常汝镇;邱丽娟

作者机构：

关键词： 大豆;SNP;分型;片段长度差异等位基因特异性PCR

期刊名称：大豆科学

ISSN： 1000-9841

年卷期： 2007 年 26 卷 04 期

页码： 5-11+17

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 单核苷酸多态性(SNP)在大豆基因组中分布广泛,SNP分型是大豆SNP遗传作图,关联分析、分子标记辅助选择等研究的重要技术。本文以Rhg4基因开发的5个SNP为例,介绍了一种大豆SNP分型的新方法-片段长度差异等位基因特异性PCR(FLDAS-PCR)。采用AS-PCR原理,针对某个SNP位点设计2条相差4-5bp的特异引物和1个公用引物,PCR产物约100bp或150bp,2种等位基因型PCR产物相差4-5bp,在2个特异引物3′端第3和4碱基位置分别人为引入错配碱基来提高PCR特异性,通过6%变性聚丙烯酰胺凝胶电泳可将纯合和杂合基因型检测出来。探讨了特异引物浓度和退火温度对Rhg4-1592扩增效果的影响,研究表明,可通过调整特异引物浓度和退火温度优化扩增效果。FLDAS-PCR对18份种质分型结果与PCR产物克隆测序法一致,表明本研究建立的FLDAS-PCR法是一种简便、快捷、新型的大豆SNP分型方法。

分类号： S565.1

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