数字农科院2.0

甘肃省甘南州家畜细粒棘球蚴病例特征及其病原遗传多样性分析

文献类型： 中文期刊

作者： 严斌昌;米荣升;邵云全;黄玉富;石玉桂;赵宏

作者机构：

关键词： 细粒棘球绦虫;囊型棘球蚴病;甘肃省甘南州;nad2基因;基因型;遗传多样性

期刊名称：中国病原生物学杂志

ISSN： 1673-5234

年卷期： 2024 年 19 卷 09 期

页码：

收录情况： 北大核心（2023版） ; ; CSCD（2023-2024年度） ; ; 科技核心（2024版）

摘要： 目的 分析甘肃省甘南州细粒棘球蚴（Echinococcus granulosus）基因型、遗传多样性及群体间遗传差异，为甘南州细粒棘球溯源及制定预防控制策略提供参考。方法 收集2016-2022年甘南州玛曲县及碌曲县屠宰场家畜肝脏或肺脏感染的囊型棘球蚴病（cystic echinococcosis, CE）包囊，提取包囊基因组DNA,PCR扩增线粒体NADH脱氢酶2（nad2）基因，测序剪接后进行Blast比对，DnaSPv5软件分析nad2序列的基因型，利用Mega11软件采用邻接法构建系统进化树，再使用PopArt 1.7软件建立细粒棘球蚴nad2基因网络图，最后使用Arlequin 3.5.2.2分析nad2不同群体间的遗传差异。结果 PCR结果显示，家畜CE感染率为9.97%（64/642）,绵羊（9.14%,48/525）和牛（13.68%,16/117）感染率差异极显著（χ2=175.6,P<0.01）。nad2基因条带大小为882 bp,将测序结果与GenBank中发表的细粒棘球蚴的序列进行比对，相似度均达到99%以上。序列分析结果显示，分为G1（占90.63%,58/64）和G3（占9.37%,6/64）两个基因型，序列相似度可达100%;共有12个单倍型，其中Hap1（占50.00%,32/64）是最主要的单倍型，Hap2(占14.06%（,9/64）次之，其中Hap3是和Hap4属于G3基因型（占9.37%,6/64）。系统发生树结果显示，G1和G3基因型处在两个小的分支上，在基因网络图中以Hap1单倍型为中心，其他11个单倍型呈散射状分布；序列单倍型多样性范围为0.7086～0.7706,核苷酸多样性范围为0.00321～0.00452。甘南州两个县细粒棘球蚴种群田岛检验（Tajima's D）均为负值，表明甘南州的细粒棘球蚴种群处于扩张或净化选择的趋势，中性检验（Fu's F）推测两个县的细粒棘球蚴种群也处于扩张趋势，且存在一些特有的基因型，FST结果表明，甘南州细粒棘球蚴不同种群间遗传分化差异不显著（P>0.05）。结论 本研究发现甘南州家畜表现出较高的遗传多样性，并处于扩张趋势，存在地区特有的单倍型。共有G1和G3两个基因型，12个单倍型，其中Hap1占50%,其近缘单倍型在全世界均有分布，是甘南州乃至其他主要流行区的主要致病单倍型。

分类号：

  • 相关文献

[1]新疆新源县多房棘球蚴病病例特征及其病原基因多态性分析. 才仁,任远,米荣升,郭刚,齐文静,张壮志,郭宝平. 2022

[2]我国三省区细粒棘球绦虫基因的变异分析. 杨俊克,贾万忠,景涛,田广孚,程晓红. 2004

[3]采用微卫星标记技术研究四川省马铃薯晚疫病菌种群遗传多样性. 李颖,张敏,彭化贤,席亚东,徐成勇,刘波微. 2010

[4]连续增氧对不同基因型水稻分蘖期生长和氮代谢酶活性的影响. 赵锋,张卫建,章秀福,王丹英,徐春梅. 2012

[5]连续增氧对不同基因型水稻分蘖期生长和氮代谢酶活性的影响. 赵锋,张卫建,章秀福,王丹英,徐春梅. 2011

[6]控制包虫病的缓释剂型研究─抗包虫病犬用吡喹酮缓释包埋剂(PSRI)现场防治细粒棘球绦虫试验. 田广孚,贾万忠,张军,刘金凤,刘百林,常增荣,杨伟德,李忠清,郭万龙. 1997

[7]细粒棘球绦虫排泄分泌抗原研究——六钩蚴排泄分泌抗原的免疫原性. 朱兴全,窦兰清,史晓红,孙学勤,王晓华,牛炳亨. 1991

[8]细粒棘球绦虫重组EG95抗原在绵羊绦虫蚴病血清抗体检测中的应用. 刘红霞,张德祯,闫鸿斌,娄忠子,倪兴维,苟惠天,贾万忠. 2012

[9]细粒棘球绦虫六钩蚴排泄分泌抗原的某些生化特性研究. 朱兴全,史晓红,窦兰清,孙学勤,牛炳亨,叶炳辉,鲁德松. 1993

[10]细粒棘球绦虫排泄分泌抗原研究——原头节排泄分泌抗原的免疫原性. 朱兴全,窦兰清,孙学勤,史晓红,王晓华,牛炳亨. 1991

[11]甘南藏族自治州动物棘球绦虫感染状况调查. 赵玉敏,童苏祥,景涛,种世桂,才学鹏,景志忠,韩俭. 2009

[12]细粒棘球绦虫G3基因型(水牛株)的研究进展. 刘全元,闫鸿斌,娄忠子,李立,史万贵,刘聪暖,殷宏,贾万忠. 2013

[13]细粒棘球绦虫TPx基因的克隆及序列分析. 李航,李文卉,苟惠天,李永光,王艳华,张德林,贾万忠,史大中,付宝权. 2008

[14]细粒棘球绦虫排泄分泌抗原研究——六钩蚴排泄分泌抗原、原头节、囊液及囊壁抗原的二维电泳分析. 朱兴全,孙学勤,史晓红,窦兰清,牛炳亨. 1992

[15]控制包虫病的缓释剂研究. 田广孚,常增荣. 1997

[16]细粒棘球绦虫硫氧还蛋白过氧化物酶基因的表达及抗原性分析. 李航,李文卉,李永光,苟惠天,王艳华,张德林,贾万忠,史大中,付宝权. 2008

[17]细粒棘球绦虫六钩蚴EG95抗原基因的克隆及原核表达. 韩秀敏,贾万忠,史大中. 2005

[18]细粒棘球绦虫抗原B的研究进展. 袁维峰,巫剑,贾红,侯绍华,郭晓宇,马世春,朱鸿飞. 2013

[19]细粒棘球绦虫G3基因型（水牛株）的研究进展. 刘全元,闫鸿斌,娄忠子,李立,史万贵,刘聪暖,殷宏,贾万忠. 2013

[20]人工感染细粒棘球蚴犬粪中蛋白质组的分析. 李双男,闫鸿斌,李立,姚刚,田文俊,李文卉,张念章,吴燕涛,付宝权,贾万忠. 2018

作者其他论文 更多>>