数字农科院2.0

基于cELISA检测的绵羊抗布鲁氏菌病性状全基因组关联分析

文献类型: 中文期刊

作者: 武上杰;李佳佳;蒋琳;马月辉;丁家波;何晓红

作者机构:

关键词: 绵羊;布鲁氏菌病;竞争酶联免疫吸附试验(cELISA);全基因组关联分析(GWAS)

期刊名称:中国畜牧兽医

ISSN: 1671-7236

年卷期: 2024 年 51 卷 10 期

页码:

收录情况: 北大核心(2023版) ; ; CSCD(2023-2024年度) ; ; 科技核心(2024版) ; ; 农林核心(2020版)

摘要: 【目的】挖掘与绵羊布鲁氏菌病抗性或易感性相关的基因,以期为绵羊布鲁氏菌病抗病育种提供分子标记。【方法】以自然感染布鲁氏菌病并且未注射疫苗的绵羊为研究对象,采集50只绵羊的血液样本进行竞争酶联免疫吸附试验(competitive enzyme-linked immunosorbent assay, cELISA)。对绵羊血液DNA进行全基因组重测序,以cELISA结果为数量性状表型,利用GEMMA软件进行全基因组关联分析。使用clusterProfiler软件包对显著基因进行功能富集分析。【结果】全基因组关联分析筛选到Top 1 000的位点共注释到56个基因,GO功能富集结果显示,注释基因主要富集在β选择和αβ T细胞增殖和分化等条目;KEGG通路富集分析结果显示,注释基因主要富集在Th1/Th2/Th17细胞分化和自然杀伤细胞介导的细胞毒性等通路,主要涉及γ-干扰素受体1(interferon gamma receptor 1,IFNGR1)、活化T细胞核因子2(nuclear factor of activated T cells 2,NFATC2)、NF-κB抑制因子β(NF-κB inhibitor beta, NFKBIB)、脾酪氨酸激酶(spleen associated tyrosine kinase, SYK)、转化生长因子β受体2(transforming growth factor beta receptor 2,TGFBR2)和T细胞受体相关蛋白激酶70的Zeta链(Zeta chain of T cell receptor associated protein kinase 70,ZAP70)共6个基因,筛选到的条目、通路和基因与布鲁氏菌的感染或宿主的抗感染密切相关。【结论】本研究筛选到6个与绵羊布鲁氏菌病相关的基因,为进一步细胞或个体水平的功能验证奠定了基础,为绵羊布鲁氏菌病抗病育种分子标记提供了参考。

分类号:

  • 相关文献

[1]圈养绵羊布鲁氏菌病支原体肺炎衣原体病的血清学检测. 贺泂杰. 2014

[2]布鲁氏菌S2、M5及A19疫苗免疫羊抗体消长规律研究. 孙晶晶,吴锦艳,曹小安,陈妍,尹双辉,周建华,兰喜,李学瑞,刘永生,尚佑军. 2020

[3]GWAS结合共表达网络分析挖掘影响油菜种子硫苷积累的作用位点. 刘蔚,姚敏,康郁,王美,解盼,何昕,刘忠松,官春云,钱伟,华玮,钱论文. 2019

[4]基于GWAS发掘甜瓜核心种质果实性状的关联位点. 王艳玲,许彦宾,李琼,王盼乔,胡建斌,杨路明,朱华玉,孙守如,马长生. 2017

[5]猪重要性状全基因组关联分析的研究进展. 赵谦,浦亚斌,关伟军,赵倩君,马月辉. 2015

[6]鸡血糖性状的全基因组关联分析. 刘晓静,刘璐,王杰,崔焕先,赵桂苹,文杰. 2020

[7]烟草开花期全基因组关联分析. 孙滢,姜自鹏,刘洪泰,孙明铭,蒋彩虹,任民,刘旦,罗朝鹏,张剑锋,杨军,杨爱国,程立锐. 2020

[8]华西牛与雪龙黑牛背最长肌重量的全基因组关联分析. 杜悦莹,安炳星,邓天宇,杜丽丽,梁忙,李柯安宁,曹晟,高会江,闵令江. 2024

[9]检测OMP28抗体不能有效诊断羊布鲁氏菌病. 王芳,蒋卉,朱良全,王楠,张阁,鑫婷,朱鸿飞,丁家波. 2014

[10]预防控制、阻断对奶牛业危害最严重的疫病之一布鲁氏菌病的传播路径. 邱昌庆. 2008

[11]辽宁省某市奶牛布病感染状况及群间传播风险因素调查. 崔基贤,王靖飞,谷志大. 2014

[12]我国部分省(区)动物布鲁氏菌病流行情况调查. 周继章,宫晓炜,曹小安,陈启伟,郑福英,费媛媛,邱昌庆. 2012

[13]检测OMP28抗体不能有效诊断羊布鲁氏菌病. 王芳,蒋卉,朱良全,王楠,张阁,鑫婷,朱鸿飞,丁家波. 2015

[14]浅谈人畜共患病——布病. 李满,史子学,志永. 2013

[15]2009-2010年我国部分省(区)动物布鲁氏菌病流行情况调查. 周继章,宫晓炜,曹小安,郑福英,蔺国珍,王光华,费媛媛,邱昌庆. 2011

[16]预防控制、阻断对奶牛业危害最严重的疫病之一家畜布鲁氏菌病防制续谈二. 邱昌庆. 2008

[17]2009-2010年我国部分省(区)动物布鲁氏菌病的流行情况调查. 周继章. 2011

[18]黑龙江省某镇肉牛布鲁氏菌感染情况调查. 汪淼,王靖飞,张俊峰,孙刚. 2014

[19]猪衣原体病和布鲁氏菌病血清学调查. 何启盖,陈焕春,吴斌,汪超,吴美洲,邱昌庆,李树春,逯忠新. 2000

[20]布鲁氏基因结构与功能研究. 金红,宋晓华. 2001

作者其他论文 更多>>