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大豆长链非编码RNA lncRNA77580转基因材料的转录组分析

文献类型： 中文期刊

作者： 牛风娟;陈向前;高飞;孙现军;胡正;张惠媛;王丽侠;姜奇彦;张辉

作者机构：

关键词： 大豆;长链非编码RNA;转录组分析;逆境胁迫;基因编辑;发状根

期刊名称：植物遗传资源学报

ISSN： 1672-1810

年卷期： 2022 年

页码：

收录情况： 北大核心（2020版） ; CSCD（2021-2022年度） ; 科技核心（2021版） ; 农林核心（2020版）

摘要： 长链非编码RNAs （lncRNAs， long non-coding RNAs） 是长度在200个核苷酸以上的功能性RNA分子，在植物的生长发育及逆境应答中发挥重要调控功能。前期研究发现一个大豆盐胁迫响应lncRNA，称其为lncRNA77580，它的大片段缺失和过表达影响其邻近蛋白编码基因的表达。本研究通过lncRNA77580转基因材料的转录组分析，探究lncRNA77580可能的功能及调控网络。在大豆发状根中过表达lncRNA77580，转基因复合体表现为盐敏感；利用dual-sgRNA/Cas9成功实现lncRNA77580大于4 kb的大片段敲除，突变效率为12.5%。利用lncRNA77580转基因材料进行RNA-seq分析发现，lncRNA77580过表达和大片段缺失显著改变了转基因发状根的基因表达谱。差异表达基因 （DEGs， differentially expressed genes） GO和KEGG富集分析表明，lncRNA77580过表达或敲除主要影响了大量转录因子和信号传导类基因的差异表达，这些差异表达基因与植物逆境应答及生长发育密切相关。说明lncRNA77580可能是在大豆逆境胁迫响应及生长发育过程中具有重要功能的一个长链非编码RNA。

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