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长链非编码RNA在猪脂肪和肌肉组织的DNA甲基化研究

文献类型： 中文期刊

作者： 周中银;李爱民;柳延虎;王立刚;王璐;王立贤;谢海兵;张亚平

作者机构：

关键词： 猪;lincRNA基因;DNA甲基化

期刊名称：

ISSN：

年卷期： 2015 年

页码： 1

收录情况： CSCD

摘要： 随着高通量测序技术的发展,越来越多的长链非编码RNA(lncRNA)被鉴定出来。在以前的一项研究中,我们在猪的基因组中鉴定了4515个lincRNA基因(6621个lincRNA转录本)。为了研究lincRNA在猪的脂肪和肌肉组织的甲基化模式,我们重新分析了已发表的藏猪、长白猪和荣昌猪的脂肪和肌肉的甲基化测序(MeDIP-Seq)数据。我们发现lincRNA基因的甲基化水平高于蛋白编码基因的甲基化水平,在启动子、外显子和内含子区域也有相同的趋势。在转录起始位点区域(TSS),lincRNA基因和蛋白编码基因也有不同甲基化模式。此外,我们发现一些lincRNA基因和差异甲基化区域(DMR)重叠,...

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