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细粒棘球蚴RTN4基因的克隆及序列分析

文献类型： 中文期刊

作者： 刘田莉;孟庆玲;乔军;陈诚;马玉;胡政香;才学鹏;陈创夫

作者机构：

关键词： 细粒棘球蚴;抗原基因;基因克隆;生物信息学分析

期刊名称：西北农林科技大学学报(自然科学版)

ISSN： 1671-9387

年卷期： 2016 年 44 卷 03 期

页码： 17-22

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 【目的】克隆细粒棘球蚴(Eg)内质网膜蛋白4(Reticulon-4,RTN4)抗原基因,对其序列进行生物信息学分析。【方法】采集感染Eg的绵羊肝脏和肺脏,提取Eg头节总RNA为模板,对RTN4基因进行RT-PCR扩增,将PCR产物克隆到pMD19-T载体后测序,对其核苷酸序列及氨基酸序列进行生物信息学分析。【结果】Eg RTN4cDNA全长654bp,编码217个氨基酸,蛋白质分子质量为25.3ku,等电点为8.83。编码氨基酸序列中含有1个N端酰基化位点、2个酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化位点和4个蛋白激酶C磷酸化位点。经生物信息学软件预测,RTN4蛋白的抗原表位区主要集中在第1-47位、第71-147位和第171-217位区域;含有2个高度疏水区,2个跨膜区,膜外区分别位于第1-47位和第171-217位。【结论】成功克隆了Eg RTN4基因,预测了其编码蛋白抗原的结构和表位。

分类号： S852.734

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