数字农科院2.0

利用高通量测序技术鉴定棉纤维发育相关miRNAs及其靶基因

文献类型： 中文期刊

作者： 南文智;吴嫚;于霁雯;范术丽;黄双领;李兴丽;张红卫;张金发;喻树迅

作者机构：

关键词： 棉花miRNA;高通量测序;棉花D5基因组;靶基因预测

期刊名称：棉花学报

ISSN： 1002-7807

年卷期： 2013 年 25 卷 04 期

页码： 300-308

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： miRNA(microRNA)是一类21～24个核酸长度的非编码小分子RNA(sRNA),它主要通过抑制或降解靶基因来调控植物生长发育等过程。试验利用在纤维长度上有显著差异的2个回交自交系BILs(Backcrossinbred lines)的0 DPA(Days post anthesis)、3 DPA的胚珠和10 DPA的纤维构建6个sRNA文库并进行Solexa测序。以已公布的棉花D5基因组序列和棉属其他序列为参考,经分析共发现561个miRNAs,其中包括254个已知的miRNAs(属于40个miRNA家族),75个候选的miRNAs和232个新的miRNAs,研究结果极大地丰富了棉属miRNAs。通过miRNA靶基因预测分析发现多数miRNAs负调控其对应的靶基因,少数正调控。KEGG(Kyoto encyclopedia of genes and genomes)注释结果表明miRNA的靶基因在植物激素代谢途径中显著富集。

分类号： S562

  • 相关文献

[1]陆地棉无绒突变体miRNA的鉴定及其靶标基因分析. 王金金,马启峰,倪志勇,范术丽. 2019

[2]棉花盐胁迫下叶片miRNAs的鉴定与分析. 彭振,龚文芳,何守朴,庞保印,杜雄明. 2014

[3]印加孔雀草对土壤细菌群落多样性的影响. 郓玲玲,张瑞海,宋振,付卫东,王然,王忠辉,张国良. 2020

[4]秸秆配施腐熟剂对土壤细菌群落及养分状况的影响. 黄玲,张自阳,赵若含,郭好娟,张璐瑶,李冰洁,卢奎,武忠伟. 2019

[5]孔雀石绿降解菌群多样性及高效降解菌的降解特性分析. 王亚妮,宋金龙,韩刚,穆迎春,江旭,王金耀,阮志勇,李乐. 2019

[6]龟纹瓢虫幼虫体内主要共生菌种类分析. 吴林珂,张帅,雒珺瑜,张利娟,吕丽敏,朱香镇,王丽,崔金杰. 2018

[7]基于转录组数据的印度谷螟微卫星位点分析. 唐培安,陶冶心,薛昊,袁明龙. 2017

[8]利用亚硝基胍诱变和高通量测序技术分析疯草内生真菌产SW生物合成通路. 郝宝成,宋向东,高艳,王学红,刘宇,陈柯源,梁妍,胡毓瑶,邢小勇,温峰琴,胡永浩,梁剑平. 2019

[9]贵紫麦1号籽粒色素形成相关基因的差异表达. 徐熙,任明见,李鲁华,杨喜翠,徐如宏. 2018

[10]贝加尔针茅草原土壤真菌群落结构对氮素和水分添加的响应. 张海芳,刘红梅,赵建宁,李刚,赖欣,李洁,王慧,杨殿林. 2018

[11]不同再生水灌溉方式对土壤-辣椒系统中细菌群落多样性及病原菌丰度的影响. 崔丙健,高峰,胡超,李中阳,樊向阳,崔二苹. 2019

[12]典型煤层水微生物产甲烷潜力及其群落结构研究. 来守超,方晓瑜,涂波,陈浩,邓泽,李贵中,陈振宏,张辉,承磊. 2020

[13]假眼小绿叶蝉微卫星位点的生物信息学分析. 李倩,陈学新,韩宝瑜. 2016

[14]新疆泥火山微生物群落. 覃千山,承磊,张辉,胡国全. 2015

[15]不同土壤玉米根际挥发性有机物组成和微生物群落特征. 李艳玲,宋阿琳,卢玉秋,王恩召,唐治喜,刘雄舵,范分良. 2019

[16]河套灌区不同秋浇年限对土壤细菌群落的影响. 张晓丽,张宏媛,卢闯,逄焕成,靳存旺,高喜,程挨平,李玉义. 2019

[17]基于新一代测序技术的昆虫转录组学研究进展. 张棋麟,袁明龙. 2013

[18]高通量测序技术结合正向遗传学手段在基因定位研究中的应用. 陆才瑞,邹长松,宋国立. 2015

[19]利用Solexa测序技术鉴定甜橙miRNAs. 王永江,李中安,张振臣,杨方云,周彦. 2013

[20]高通量测序技术在鉴定木本植物双生病毒中的应用. 李世访. 2016

作者其他论文 更多>>