花生矮化病毒(PSV)Mi株系RNA3全序列分析
文献类型: 中文期刊
作者: 许泽永;晏立英;陈坤荣;Marcel Prins
作者机构:
关键词: 花生矮化病毒;RNA3全序列;同源性分析;新PSV亚组
期刊名称:农业生物技术学报
ISSN: 1006-1304
年卷期: 2004 年 12 卷 04 期
页码: 436-441
收录情况: CSCD
摘要: 完成了中国花生矮化病毒(Peanutstuntvirus, PSV)Mi株系RNA3全序列分析。PSV-Mi RNA3全长2170个核苷酸,含两个开放阅读框架(ORF),分别编码3a运动蛋白和壳蛋白(CP)。PSV-Mi RNA3核苷酸序列和PSV亚组ⅠER和J 株系同源性为77.7%和78.5%,与亚组ⅡW株系同源性为76.7%;同一亚组ER和J株系RNA3序列同源性为91%。PSV-Mi 3a和cp基因与PSV-ER, J and W株系同源性分别为78.3%~79.3%和74.4%~77.8%。PSV-Mi 3a和CP蛋白氨基酸序列与PSV-ER, J and W株系同源性分别为73.9%~77.4%和64.8%~77.5%。PSV-Mi RNA3 5’UTR和IR区域有较大的变异性,与PSV-ER, J and W株系序列同源性分别为78.4%~79.8%和70.2 %~73.2%,明显低于亚组Ⅰ、Ⅱ两个亚组间株系在这两个区域序列同源性。上述结果说明我国PSV Mi株系不同于已报道的PSV两个亚组,独自构成一个新亚组,即亚组Ⅲ。
分类号: S432.4
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