基于SSR的西南地区野生菰资源遗传多样性及遗传结构分析
文献类型: 中文期刊
作者: 黄雪雯;王惠梅;苏晓娜;王圣子海;熊琦哲;江绍琳;吴建利;江绍玫
作者机构:
关键词: 野生菰;SSR标记;遗传多样性;遗传结构
期刊名称:江西农业大学学报
ISSN: 1000-2286
年卷期: 2017 年 39 卷 2 期
页码: 409-418
摘要: 菰属(Zizania latifolia(Griseb.)Trucz.)为禾本科水稻近缘属之一,携带水稻育种所需的多种优良性状基因。采用本项目前期筛选出来的19对水稻SSR标记,对我国西南地区4省市25个野生菰居群进行了遗传多样性及遗传结构分析。POPGEN32软件分析显示,19对SSR标记扩增谱带的多态性条带百分比为100%;在物种水平上,西南地区野生菰等位基因数和有效等位基因数分别为2和1.608,Nei’s基因多样性指数和Shannon’s多样性信息指数分别为0.349和0.517;25个野生菰居群间的遗传相似性系数为0.603 6~0.937 2,遗传距离介于0.064 8~0.504 8。NTsys2.10e聚类分析结果显示,阈值在0.196时,25个居群聚被分成10组;阈值为0.238时,第Ⅰ组可再聚分为4个亚组。居群间平均基因流为Nm=0.788。AMOVA分析结果显示,西南地区野生菰88.87%的变异存在于居群内部,11.13%的变异存在于居群间。研究结果表明,西南地区野生菰资源有着丰富的遗传多样性,遗传漂变在西南地区野生菰植物的遗传分化中起到了一定的作用,各居群的聚类结果与地理分布无明显相关性。推测选择压力可能在西南地区野生菰遗传分化中起着重要作用。研究结果有助于加深对我国西南地区乃至更大范围内野生菰资源遗传进化的认识,同时为野生菰种质资源保护提供理论依据。
分类号: S511.9
- 相关文献
[1]利用SSR标记分析东北野生菰遗传多样性和遗传结构. 苏晓娜 , 王惠梅 , 黄雪雯 , 谢小燕 , 张孝天 , 牛恋 , 董琳 , 江绍琳 , 吴建利 *, 江绍玫 *. 2018
[2]“十五”大豆创新种质和1963—1995年间育成品种的SSR遗传结构及遗传多样性分析. 李英慧,刘燕,关荣霞,魏淑红,杨光宇,周新安,张孟臣,杨春燕,朱保葛,李卫东,刘学义,徐冉,孙君明,朱申龙,赵团结,刘章雄,常汝镇,邱丽娟. 2007
[3]"十五"大豆创新种质和1963-1995年间育成品种的SSR遗传结构及遗传多样性分析. 李英慧,刘燕,关荣霞,魏淑红,杨光宇,周新安,张孟臣,杨春燕,朱保葛,李卫东,刘学义,徐冉,孙君明,朱申龙,赵团结,刘章雄,常汝镇,邱丽娟. 2007
[4]四川省稻瘟病菌群体遗传结构分析. 王玲 (2), 左示敏 , 张亚芳 , 陈宗祥 , 潘学彪 *, 黄世文 *. 2015
[5]基于SSR标记的西南地区野生带叶兜兰资源遗传多样性分析. 徐言,陈之光,徐玉凤,葛红,杨树华,赵鑫,寇亚平,于晓南,贾瑞冬. 2023
[6]东南沿海短绒野大豆两种代表性生境自然种群的空间遗传结构特征—种群内取样策略研究. 王浩辰,王克晶,韩娟,李向华. 2025
[7]基于两种电泳检测方法的华东野生菰ISSR遗传多样性分析. 谢小燕 , 苏晓娜 , 王惠梅 , 江绍琳 , 吴建利 , 江绍玫. 2019
[8]陕西省异色瓢虫种群遗传结构及其多样性. 李菁,张小飞,徐玲玲,刘津,白明皓,王振营. 2018
[9]利用SSR标记揭示中国粳稻地方品种遗传多样性. 张立娜,曹桂兰,韩龙植. 2012
[10]中国重要农业害虫韭菜迟眼蕈蚊多态性EST-SSR标记的开发(英文). 张存环,台术蕾,王磊,郭雅男,杨峰山,赵传志,万方浩,褚栋. 2016
[11]广西茶树地方品种遗传多样性和遗传结构的EST-SSR分析. 周炎花,乔小燕,马春雷,乔婷婷,金基强,姚明哲,陈亮. 2011
[12]河流型水牛尼里-拉菲和摩拉水牛群体遗传结构分析. 徐文文,孙甜甜,覃广胜,贾银海,王国利,刘瑞鑫,杨秀荣,蒋和生. 2019
[13]贵州栽培稻的遗传结构及其遗传多样性. 张冬玲,张洪亮,魏兴华,齐永文,王美兴,孙俊立,丁立,汤圣祥,裘宗恩,曹永生,王象坤,李自超. 2006
[14]浙江省茶树地方品种与选育品种遗传多样性和群体结构的EST-SSR分析. 乔婷婷,马春雷,周炎花,姚明哲,刘饶,陈亮. 2010
[15]利用EST-SSR标记研究适制绿茶与乌龙茶品种的遗传多样性与遗传结构. 吴晓梅,姚明哲,马春雷,王新超,陈亮. 2010
[16]黑龙江省大豆种质遗传结构及遗传多样性分析. 秦君,李英慧,刘章雄,栾维江,闫哲,关荣霞,张孟臣,常汝镇,李广敏,马峙英,邱丽娟. 2009
[17]基于EST-SSR的广东与广西茶树资源遗传结构和遗传分化比较分析. 乔小燕,乔婷婷,周炎花,金基强,马春雷,姚明哲,陈亮. 2011
[18]家养梅花鹿品种Y染色体遗传多样性和父系遗传结构. 周盼伊,邵元臣,刘华淼,张然然,王磊,邢秀梅. 2016
[19]大豆地方品种的遗传多样性及结构分析. 李英惠,刘章雄,关荣霞,常汝镇,邱丽娟. 2005
[20]利用SSR分析华中、华东五大湖区野生菰的遗传结构与多样性. 王惠梅 , 苏晓娜 , 黄雪雯 , 王圣子海 , 熊琦哲 , 江绍琳 , 江绍玫 *, 吴建利 *. 2018
作者其他论文 更多>>
-
5460个三系杂交稻品种的不育系细胞质来源分析
作者:李伟;徐霞;边莹;张晓波;范炯炯;程本义;杨仕华;吴建利;魏鑫;曾波;龚俊义
关键词:三系杂交稻;品种资源;不育系细胞质;系谱;育种利用
-
OsbZIP53 Negatively Regulates Immunity Response by Involving in Reactive Oxygen Species and Salicylic Acid Metabolism in Rice
作者:吴丽娟;韩聪;王惠梅;何禹畅;林海;王磊;陈忱;鄂志国
关键词:
-
伯克霍尔德氏菌JP2-270抗水稻纹枯病菌机理的初步研究
作者:吴丽娟;韩聪;王惠梅;王磊;鄂志国
关键词:伯克霍尔德;水稻纹枯病;硝吡咯菌素;转录调控蛋白BysR
-
利用CRSPR/Cas9技术创制抗稻瘟病香型早籼温敏核不育系
作者:梁敏敏;张华丽;陈俊宇;戴冬青;杜成兴;王惠梅;马良勇
关键词:水稻;CRISPR/Cas9;Badh2;Pi21;TMS5
-
水稻斑点叶突变体hm197的鉴定及其基因定位
作者:李小红;施勇烽;张晓波;奉保华;宋莉欣;王惠梅;徐霞;黄奇娜;郭丹;吴建利
关键词:斑点叶突变体;白叶枯病抗性;基因定位;水稻
-
水稻褐色颖壳新等位基因OsFBX310~(bh6)的克隆鉴定
作者:徐霞;张晓波;施勇烽;王惠梅;黄奇娜;奉保华;李小红;郭丹;吴建利
关键词:水稻;褐色颖壳突变体;分子标记;OsFBX310;类黄酮代谢
-
基于 SSR 和 ISSR 的鄱阳湖流域野生菰资源的遗传多样性分析
作者:王惠梅;吴国林;江绍琳;黄奇娜;奉保华;黄长干;江绍玫;吴建利
关键词:菰;居群;遗传多样性;SSR 标记;ISSR 标记
