数字农科院2.0

砀山酥梨TCP基因家族全基因组鉴定与分析

文献类型： 中文期刊

作者： 冀志蕊;董庆龙;谷彦冰;吴建圆;迟福梅;徐成楠;张俊祥;乔壮;周宗山

作者机构：

关键词： 砀山酥梨;TCP基因家族;全基因组鉴定;进化分析

期刊名称：基因组学与应用生物学

ISSN： 1674-568X

年卷期： 2017 年 2 期

页码： 766-773

收录情况： 北大核心（2020版） ; CSCD（2020-2021年度） ; 科技核心（2020版）

摘要： TCP蛋白是植物特有的转录因子家族之一,在植物生长和发育等多个过程起到重要作用。本研究利用生物信息学方法对砀山酥梨TCP基因家族成员、染色体定位、进化分析、亚组分类、保守域结构和保守元件进行了相关分析。结果显示,梨TCP基因家族含有34个成员;进化分析表明,根据进化树拓扑结构将其分为两类:ClassⅠ和ClassⅡ,其中ClassⅡ可被分为CYC/TB1和CIN两个小组。结构域分析表明,梨TCP基因家族TCP结构域高度保守;保守元件分析表明,梨TCP基因家族包含5个保守元件:元件1是TCP保守域;元件2为R结构域,元件3、4和5为功能尚未鉴定的结构域,所有梨TCP蛋白都含有元件1,ClassⅡ组中CYC/TB1小组包含特异元件2。以上结果将为今后揭示梨TCP基因的功能提供重要的理论基础。

分类号： Q943.2`S661.2

  • 相关文献

[1]葡萄TCP基因家族全基因组鉴定和分析. 冀志蕊,谷彦冰,董庆龙,迟福梅,乔壮,徐成楠,张俊祥,周宗山. 2015

[2]雷蒙德氏棉和亚洲棉TCP基因家族的生物信息学分析. 李燕,姚金波,陈伟,张永山. 2016

[3]柑橘属SAUR基因家族的全基因组鉴定及表达分析. 王福生,余洪,胡洲,管德龙,张盼,朱世平,赵晓春. 2020

[4]大豆NF-YB家族全基因组鉴定、分类和表达. 郑炜君,徐兆师,冯志娟,李连城,陈明,柴守诚,马有志. 2012

[5]短柄草Hsf家族全基因组鉴定、分类和高温响应. 李盼松,郑炜君,周永斌,陈明,柴守诚,马有志,马翎健,徐兆师. 2015

[6]花生GRF和GIF基因家族的鉴定与表达分析. 吴洁,淮东欣,薛晓梦,郅晨阳,晏立英,陈玉宁,王欣,康彦平,王志慧,雷永,廖伯寿. 2023

[7]金荞麦C2H2-ZFP家族基因分析及FdC2H2-2在芦丁合成积累中的功能表征. 龙欧,卢翔,石亚亮,李光胜,张凯旋,王俊珍,周美亮. 2023

[8]紫花苜蓿SAUR基因家族的鉴定及其在非生物胁迫中的表达模式研究. 刘昊,李显炀,何飞,王雪,李明娜,龙瑞才,康俊梅,杨青川,陈林. 2023

[9]橘小实蝇离子型受体基因家族的全基因组注释及分析. 杨明寰,王齐,严善春,刘伟,王桂荣. 2025

[10]甘蓝型油菜GSK基因家族的全基因组鉴定及核盘菌诱导应答分析. 彭广兰,刘红芳,吝彩玲,王明宇,华玮,刘文,郑明. 2025

[11]燕麦NF-YA基因家族分析及表型鉴定. 王思琦,武雅婧,朱鹤,杨青川,康俊梅,郭长虹,王雪. 2026

[12]货架温度对砀山酥梨黑皮病及生理指标的影响. 王志华,姜云斌,王文辉,张志云,姜修成,佟伟. 2012

[13]急速降温对砀山酥梨采后生理和保鲜效果的影响. 王志华,姜云斌,王文辉,杭博,姜修成,杜艳民,佟伟,贾晓辉. 2015

[14]极早熟梨新品种——早酥蜜. 杨健. 2016

[15]山西砀山酥梨适宜采收成熟度研究. 王志华,姜云斌,王文辉,佟伟,杜艳民,杭博,贾晓辉. 2014

[16]1-MCP处理对不同产地酥梨低温贮后货架期防褐保鲜效应的研究. 王宝亮,王文辉,姜云斌,姜修成,王志华. 2014

[17]高渗CO2和PE保鲜袋对冷藏及货架期砀山酥梨果实品质的影响. 王志华1,姜云斌2,王文辉1,杜艳民1,杭博1,姜修成1,佟伟1,贾晓辉1. 2014

[18]我国北方特色梨良种. 朱佳满,王永忠. 2003

[19]极早熟梨新品种-早酥蜜. 杨健. 2016

[20]1-MCP对砀山酥梨保鲜效果的影响. 孙希生,王文辉,李志强,王志华,张志云. 2001

作者其他论文 更多>>