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广西药用野生稻遗传多样性分析及SSR引物数量对遗传多样性结果的影响研究

文献类型： 中文期刊

作者： 苏龙;徐志健;乔卫华;郑晓明;梁云涛;丁膺宾;刘莎;齐兰;公婷婷;梁新霞;王君瑞;张丽芳;程云连;兰进好;杨庆文

作者机构：

关键词： 药用野生稻;遗传多样性中心;聚类分析;SSR引物数量

期刊名称：植物遗传资源学报

ISSN： 1672-1810

年卷期： 2017 年 4 期

页码： 603-610

收录情况： 北大核心（2020版） ; CSCD（2020-2021年度） ; 农林核心（2020版） ; 科技核心（2020版）

摘要： 采用25对SSR分子标记,对广西境内采集的1610份药用野生稻材料进行遗传多样性和聚类分析,其中检测到等位变异181个,有效等位基因数Ae范围为1.0094(RM240)~2.2674(RM488),平均值为1.3568;期望杂合度He范围为0.0093(RM240)~0.5591(RM448),平均值为0.2112;Shannon多样性指数I在0.0393~0.9296之间变动,平均值为0.3624。数据表明,广西药用野生稻遗传多样性较为丰富,12个药用野生稻地理居群按遗传多样性指数大小排序为:梧州-3>南宁-1>梧州-2>梧州-1>南宁-2>玉林-2>贵港-2>梧州-4>玉林-3>玉林-1>贺州>贵港-1,其中指数高的居群均分布于梧州市和南宁市两地,因此确定了这两地为广西药用野生稻的遗传多样性中心。通过不同数量的SSR引物对药用野生稻材料间相似系数矩阵进行相关性测验,结果显示当引物按照PIC值降序排列时,10对引物即达到较好聚类效果,升序排列时,21对引物即达到较好聚类效果。研究表明,在进行药用野生稻大居群聚类分析时,SSR引物适宜数量应多于21对,最低不得少于10对。

分类号： S511.9

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