猫细小病毒HH-1/86株理化性质鉴定及全基因组测序
文献类型: 中文期刊
作者: 程楠;赵永坤;于永乐;希冀;王化磊;冯娜;张渭蛟;高玉伟;杨松涛;刘维全;夏咸柱
作者机构:
关键词: 猫细小病毒;血凝;两端反向重复序列;序列分析
期刊名称:中国兽医学报
ISSN: 1005-4545
年卷期: 2017 年 37 卷 5 期
页码: 818-822
收录情况: 北大核心(2020版) ; CSCD(2020-2021年度) ; 农林核心(2020版) ; 科技核心(2020版)
摘要: 本试验对HH-1/86株细小病毒进行了理化性质鉴定和全基因组序列分析。研究结果表明,电镜下可见少量直径20nm左右的立体对称细小病毒粒子。该病毒对热、酸、乙醚具有一定的耐受性,pH在5.8~6.8的0.015mol/L PBS均能凝集0.1%猪红细胞,其中pH6.5血凝活性最佳。HH-1/86株细小病毒的全基因长5 123nt。其中,A+T含量63.65%,C+G的含量为36.35%。3′末端反向重复序列(inverted terminal repeats,ITR)形成Y型结构,长126nt;5′末端ITR形成U型结构,长198nt。利用MEGA 6.0软件的邻接法(Neighbor-Joining,Replication=1 000)对NS1和VP2基因编码氨基酸进行的种系发生树分析表明,VP2蛋白归于FPV分支,VP2蛋白10个决定抗原性、血凝性和宿主范围的关键氨基酸位点与FPV参照株一致;而NS1蛋白相对保守,归于独立的分支。
分类号: S855.3
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