柑橘黄化脉明病毒和衰退病毒的二重RT-PCR检测体系的建立与应用
文献类型: 中文期刊
作者: 赵恒燕;关桂静;周常勇;于云奇;王洪苏;李中安;刘金香
作者机构:
关键词: 柑橘;柑橘黄化脉明病毒;柑橘衰退病毒;二重RT-PCR;检测
期刊名称:园艺学报
ISSN: 0513-353X
年卷期: 2017 年 7 期
页码: 1405-1414
摘要: 选用柑橘黄化脉明病毒(Citrus yellow vein clearing virus,CYVCV)和柑橘衰退病毒(Citrus tristeza virus,CTV)两种病毒外壳蛋白保守序列及内参基因Ubiquitin的特异性引物,优化影响二重RT-PCR反应的Mg~(2+)浓度、dNTPs浓度、引物浓度和退火温度,建立了针对两种病毒的一步法二重RT-PCR检测体系。二重RT-PCR获得CYVCV、CTV及Ubiquitin的特异性片段大小分别为614、373和194 bp,克隆测序和序列对比结果显示它们与已报道的病毒序列具有较高的同源性。该体系最低能从40 ng·μL~(-1)总核酸中检测出CYVCV,从4 ng·μL~(-1)总核酸中检测出CTV,其灵敏度与单一RT-PCR检测灵敏度一致。利用该体系对33份田间样品进行检测,CYVCV和CTV感染率分别为54.5%和66.7%,复合侵染率高达36.4%。该一步法二重RT-PCR技术体系可用于大量田间样品中CYVCV和CTV的快速同步检测。
分类号: S436.66
- 相关文献
[1]应用实时荧光RT-PCR检测柑橘黄化脉明病毒. 陈洪明,周彦,王雪峰,周常勇,杨秀燕,李中安. 2016
[2]柑橘黄化脉明病毒的TGB基因生物信息学分析及亚细胞定位. 崔甜甜,王艳娇,李中安,周常勇,宋震. 2017
[3]柑橘黄化脉明病毒DTBIA检测方法的建立. 宾羽,宋震,李中安,周常勇. 2015
[4]柑橘黄化脉明病毒RT-LAMP检测方法的建立. 刘科宏,陈洪明,周彦,李中安. 2015
[5]应用real-time RT-PCR监测柑橘衰退病毒强、弱毒株的时序变化. 邹勤,周彦,李中安,周常勇,刘永清,苏华楠. 2011
[6]寄主凤凰柚对柑橘衰退病病毒甜橙分离株构成的影响. 王志刚,周常勇,周彦. 2007
[7]柑橘品种对不同基因型柑橘衰退病毒的抑制及变异的影响. 唐萌,金鑫,周常勇,李中安,陶珍珍,周彦. 2016
[8]柑橘衰退病毒RT-LAMP快速检测方法的建立. 王永江,周彦,李中安,苏华楠,黄爱军,唐科志,周常勇. 2013
[9]浙江柑橘产区柑橘黄脉病毒的发生、分布与分子特性研究. 张艳慧,刘莹洁,王琴,李雪燕,胡文召,戴祥生,周彦. 2017
[10]柑橘多甲氧基黄酮的检测及分离纯化技术研究进展. 黄明发,苏学素,焦必宁,付陈梅,郭莉. 2009
[11]柑橘鳞皮病毒RT-LAMP检测方法的建立与应用. 李敏,周天宇,吴佳星,周彦,曹孟籍,李中安. 2019
[12]柑橘褪绿矮化相关病毒LAMP检测体系的建立. 刘科宏,陈洪明,周彦,宋震,李中安. 2017
[13]柑橘黄化脉明病毒基因组的长链RT-PCR扩增、克隆及序列分析. 崔甜甜,王艳娇,宾羽,李中安,周常勇,宋震. 2017
[14]甜橙和柚中CTV强弱毒株系p20的遗传变异. 王亚飞,阮涛,周彦,王雪峰,吴根土,孙现超,周常勇,青玲. 2017
[15]基于p23基因的野生柑橘和栽培柑橘上衰退病毒分离株间的遗传特征分析. 易龙,周常勇. 2017
[16]4种柑橘衰退病毒源单蚜传毒分离株CP基因的分子特征. 徐小峰,周常勇,宋震,王雪峰,周彦. 2007
[17]柑橘衰退病毒基因组的简单重复序列分布分析. 谭钟扬,李世访,王红清. 2013
[18]柑橘三种蚜虫取食行为的EPG分析. 何应琴,陈文龙,鲁卓越,周常勇,李中安,李太盛. 2015
[19]应用多重PCR技术同步检测柑橘4种重要嫁接传播病原(英文). 刘金香,周常勇,唐科志,李玲娣,刘科宏. 2014
[20]柑橘衰退病毒侵染对寄主植物同工酶及酸性病程相关蛋白表达的影响. 范旭东,王彩霞,叶刚,王国平,洪霓. 2010
作者其他论文 更多>>
-
First report of Australian grapevine viroid infecting sweet cherry in China
作者:田夏夏;;战斌慧;;周常勇;;李世访;;张志想
关键词:樱桃;;类病毒
-
基于CRISPR/LanCas9的水稻基因编辑系统的开发和优化
作者:李欣格;王美霞;王晨阳;马桂根;周常勇;王亚南;周焕斌
关键词:CRISPR;LanCas9;SLanCas9;基因编辑;水稻
-
Changes in metabolism modulate induced by viroid infection in the orchid Dendrobium officinale
作者:李帅;;吴志刚;;周莹;;董振飞;;费璇;;周常勇;;李世访
关键词:
-
RNA-dependent RNA polymerase 1 delays the accumulation of viroids in infected plants
作者:李帅;;张志想;;周常勇;;李世访
关键词:RDR1;resistance;RNA silencing;SA;salicylic acid;tobacco;tomato;viroid
-
马蜂柑响应黄龙病菌不同侵染时期的生物学和转录组学分析
作者:滕彩玲;钟晰;吴昊娣;胡燕;周常勇;王雪峰
关键词:柑橘黄龙病;韧皮部杆菌亚洲种;马蜂柑;耐病性;转录组
-
柑橘黄龙病菌分泌蛋白05150的筛选、原核表达及抗血清制备
作者:晏建红;关巍;宾羽;黄洋;周常勇;赵廷昌
关键词:柑橘黄龙病;分泌蛋白基因;原核表达;抗血清制备
-
柑橘鳞皮病毒RT-LAMP检测方法的建立与应用
作者:李敏;周天宇;吴佳星;周彦;曹孟籍;李中安
关键词:柑橘;柑橘鳞皮病毒;RT-LAMP;检测
