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基于转录组分析的大针茅响应羊啃食的基因表达

文献类型： 中文期刊

作者： 田青松;田文坦;李婷婷;高金玉;武志娟;韩冰

作者机构：

关键词： 大针茅;羊啃食;转录组测序;实时荧光定量PCR

期刊名称：中国草地学报

ISSN： 1673-5021

年卷期： 2017 年 3 期

页码： 1-7

收录情况： 北大核心（2020版） ; CSCD（2020-2021年度） ; 农林核心（2020版） ; 科技核心（2020版）

摘要： 利用新一代高通量测序手段对大针茅受到羊啃食后2h的实验组与未啃食的对照组叶片进行Illumina平台的转录组测序(RNA sequences),共得到147561个序列读取片段(reads),组装成64738条单基因簇(Unigenes),Unigenes平均长度为1367.21bp,N50为2017bp。随机挑选11个基因利用实时荧光定量PCR对转录组数据库进行了验证。基于转录组数据分析淀粉和蔗糖代谢通路中关键调控基因表达差异,结果表明:随机挑选的11个基因的表达差异变化与转录组数据上下调趋势一致,在淀粉与蔗糖代谢通路中相关基因的表达差异变化利于淀粉、蔗糖的积累。大针茅在羊啃食后淀粉与蔗糖含量的增加有利于结实,对后代的传播意义重大。

分类号： S543.9

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