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洋葱AcPME基因的克隆及序列分析

文献类型： 中文期刊

作者： 孙亚玲;陈立;孙雨晴;杨妍妍;吴雄;曹辰兴;霍雨猛

作者机构：

关键词： 洋葱;果胶甲酯酶(PME);克隆;序列分析

期刊名称：山东农业科学

ISSN： 1001-4942

年卷期： 2017 年 6 期

页码： 7-12+25

摘要： 以洋葱花蕾为试材,通过RACE试验获得了Ac PME基因的全长c DNA序列,Gen Bank登录号为JF913196.1。该基因DNA序列包含2 786个碱基,4个外显子,3个内含子,c DNA序列长度为2 228 bp,编码序列长度为2 001 bp,编码666个氨基酸。生物信息学分析显示Ac PME蛋白存在明显的信号肽和跨膜区域(SP/TM)、PMEI结构域和PME结构域,在PME家族分类中属于第Ⅰ类,即含有一个长的N末端前区域(PRO-region)。氨基酸同源比对与系统进化分析表明,Ac PME蛋白与水稻、玉米、高粱等单子叶植物的同源蛋白具有较高的一致性。三维结构模式图显示该蛋白具有一个明显的凹沟,4个果胶结合位点氨基酸残基(T423、Q453、R565和W567),2个活性位点氨基酸残基(D476和D497)。本研究为洋葱Ac PME基因的结构域蛋白互作及功能研究奠定了基础。

分类号： S633.2

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