数字农科院2.0

甘蔗印度种响应干旱胁迫的数字基因表达谱

文献类型： 中文期刊

作者： 李穆;程志远;何丽莲;王先宏;李富生

作者机构：

关键词： 甘蔗印度种;春尼;干旱;数字基因表达谱;差异表达基因

期刊名称：分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2018 年 7 期

页码： 2099-2106

收录情况： 北大核心（2020版） ; 农林核心（2020版） ; 科技核心（2020版）

摘要： 本研究以甘蔗印度种的代表品种"春尼"为试材,采用数字基因表达谱(DGE)技术对干旱胁迫后的"春尼"进行差异基因表达分析,共筛选到差异表达基因9 810个,其中上调表达4 687个,下调表达5 123个。GO功能显著性富集分析表明:差异表达基因主要定位于细胞质、质体、叶绿体、类囊体等,主要行使催化活性、氧化还原酶活性、辅因子结合、裂解酶活性等功能,主要涉及小分子代谢、细胞酮体代谢、有机酸代谢、含氧酸代谢、化学刺激应答、非生物刺激应答等生物过程。KEGG显著性富集分析表明:差异表达基因主要涉及植物激素信号转导、RNA转运、次生代谢产物的生物合成、淀粉和蔗糖代谢、泛素化蛋白降解、嘌呤碱代谢等通路。利用实时荧光定量PCR(q RT-PCR)分析2个差异表达上调基因在"春尼"的苗期、伸长期、成熟期受干旱诱导的表达情况,结果均为"上调-上调-上调"模式,验证了DGE测序结果可靠、重复性好。

分类号： S423`S566.1

  • 相关文献

[1]扩散型与繁殖型松材线虫数字基因表达谱对比分析. 田浩楷,张帅,柳小龙,张志伟,赵莉蔺. 2017

[2]红掌佛焰苞数字基因表达谱及关键基因表达水平分析. 彭佳佳,刘克林,刘丽娅,吕学华,杨哲,李佩愉,刘春,明军,袁素霞,平吉成,张黎. 2016

[3]公鸡弱精症相关候选基因的表达分析. 富丽,孙研研,薛夫光,刘冉冉,白皓,常国斌,陈国宏,陈继兰. 2015

[4]家蚕感染二分浓核病毒(镇江株)的数字基因表达谱分析. 高坤,尚梦珂,钱荷英,覃光星,郭锡杰. 2016

[5]利用数字基因表达谱对小尾寒羊高繁性状相关基因的筛选研究. 罗庆苗,秦晓玉,苗向阳. 2012

[6]感染和未感染南方水稻黑条矮缩病毒的白背飞虱成虫唾液腺转录组比较分析. 邓瑶,刘玉娣,王香萍,侯茂林. 2018

[7]急性T淋巴细胞性白血病关键基因的筛选与验证. 蒋光洁,陈燕华,郭维,张航,邹琳. 2018

[8]鸭胚胎发育中后期胸肌发育阻滞的RNA-seq分析. 刘宏祥,徐文娟,朱春红,陶志云,宋卫涛,章双杰,李慧芳. 2018

[9]基于RNA-Seq的甘蔗主茎和分蘖茎转录组建立及初步分析. 丘立杭,罗含敏,陈荣发,黄杏,陈忠良,范业赓,陈栋,李杨瑞,吴建明. 2018

[10]高温胁迫下番茄叶片差异表达基因的cDNA-AFLP分析. 刘志勇,杜永臣,王孝宣,国艳梅,高建昌. 2008

[11]链孢粘帚霉寄生核盘菌菌核差异表达基因的筛选及分析. 李世东,郭荣君,张拥华. 2009

[12]应用GDPs转录物标记法进行水稻白叶枯病菌早期侵染表达谱分析. 高世强,吴茂森,何晨阳. 2009

[13]半矮生型桃节间长度相关基因的筛选和鉴定. 鲁振华,李钰婷,王志强,牛良,崔国朝,王玉兰. 2013

[14]雏鸡红细胞免疫相关基因差异表达的时序性研究. 贾悦,李月健,喻进,张晨亮,李娜娜,卢晓晓,张宁,李欣,张鼎,郝卫芳,马海利,高文伟,赵宇军,高诗敏,李建慧,李桂兰,闫芳,韩凌霞,宁官保,田文霞. 2015

[15]水稻白叶枯病菌ΔgacAxoo和ΔfleQxoo突变体基因芯片转录谱分析. 吴茂森,何晨阳. 2007

[16]犬瘟热病毒感染小鼠脾淋巴细胞所引起的主要基因表达变化. 仝明薇,易立,程悦宁,王建科,赵航,程世鹏,孙长英,王文宪. 2014

[17]‘岩溪晚芦’椪柑果皮与果肉差减cDNA文库的构建及初步分析. 叶庆亮,江东,彭爱红. 2009

[18]cDNA微阵列鉴定差异表达基因的可靠性分析. 王冰林,柳俊,李媛媛,谢从华. 2008

[19]刚地弓形虫强弱毒株速殖子抑制消减cDNA文库的构建和初步分析. 周鹏,张德林,周东辉,宋慧群,林瑞庆,朱兴全. 2008

[20]基于RNA-Seq的稻瘟病菌Δznf1突变体的表达谱分析. 岳晓凤,阙亚伟,王政逸. 2016

作者其他论文 更多>>